Сконфигурируйте для Slurm, PBS Pro, платформы LSF, КРУТЯЩИЙ МОМЕНТ

Следуйте этим инструкциям, чтобы сконфигурировать вашу установку MATLAB® Parallel Server™, чтобы работать с Slurm, PBS Pro, Платформой LSF, КРУТЯЩИЙ МОМЕНТ.

Примечание

Вместо этого используйте типичный интерфейс планировщика для любого следующего:

  • Любой сторонний планировщик, не упомянутый выше (например, Engine Сетки Sun, GridMP, и т.д.)

  • PBS кроме PBS Pro

  • Неразделяемая файловая система, когда клиент не может непосредственно подчиниться планировщику (например, КРУТЯЩИЙ МОМЕНТ на Windows)

  • Когда клиентская машина MATLAB не имеет утилит третьего-Zparty планировщика установленными (например, sinfo, sbatch, squeue и sacct для Slurm)

  • Если вы хотите использовать Slurm от клиента Windows, или если у вас нет совместно используемой файловой системы с вашим кластером Slurm, или если утилиты Slurm не доступны на вашем клиенте, то используйте типичный интерфейс планировщика.

Сконфигурируйте платформу планировщик LSF на Windows Cluster

Если ваш кластер уже настраивается, чтобы использовать mpiexec и smpd, можно использовать программное обеспечение Parallel Computing Toolbox™ с существующей настройкой, если вы пользуетесь совместимой библиотекой реализации MPI (как задано в matlabroot \toolbox\distcomp\mpi\mpiLibConf.m). Однако, если у вас нет mpiexec на вашем кластере, и вы хотите использовать его, можно использовать mpiexec программное обеспечение, поставленное с продуктами параллельных вычислений.

Для получения дополнительной информации о mpiexec и smpd, смотрите домашнюю страницу MPICH. Для руководств пользователя и инструкций по установке на той странице, выберите Documentation> User Docs.

В следующих инструкциях matlabroot относится к местоположению установки MATLAB.

Чтобы использовать mpiexec, чтобы распределить задание, smpd сервис должен работать на всех узлах, которые будут использоваться для выполнения работников MATLAB.

Примечание

Исполняемый файл smpd не поддерживает выполнение от сетевого диска. Используйте или локальную установку или полное имя пути UNC к исполняемому файлу. Microsoft® Windows Vista™ не поддерживает исполняемый файл smpd на установках сетевого ресурса, таким образом, с Vista установка должна быть локальной.

  1. Войдите в систему в качестве пользователя с правами администратора.

  2. Запустите smpd путем ввода в окне команды DOS:

    matlabroot\bin\win64\smpd -install

    Эта команда устанавливает сервис и запускает его. Пока сервис остается установленным, он запустит каждый раз начальные загрузки узла.

  3. Если это - машина рабочего, и вы не запускали установщика на ней, чтобы установить программное обеспечение MATLAB Parallel Server (например, если вы запускаете программное обеспечение MATLAB Parallel Server от разделяемой установки), выполните следующую команду в окне команды DOS.

    matlabroot\bin\matlab.bat -install_vcrt
    

    Эта команда устанавливает библиотеки времени выполнения Microsoft, необходимые для рабочих заданий с вашим планировщиком.

  4. Если вы используете брандмауэры Windows® на своих кластерных узлах, выполните следующее в окне команды DOS.

    matlabroot\toolbox\distcomp\bin\addMatlabToWindowsFirewall.bat
    

    Эта команда добавляет MATLAB как позволенную программу. Если вы используете другие брандмауэры, необходимо сконфигурировать их, чтобы достигнуть подобной договоренности.

  5. Войдите в систему как пользователь, который будет представлять задания для выполнения на этом узле.

  6. Укажите этого пользователя, чтобы использовать mpiexec путем ввода:

    matlabroot\bin\win64\mpiexec -register
  7. Повторите шаги 5-6 для всех пользователей, которые запустят задания на этой машине.

  8. Повторите все эти шаги на всех узлах Windows в вашем кластере.

Сконфигурируйте Windows Firewalls на клиенте

Если вы используете брандмауэры Windows на своих кластерных узлах,

  1. Войдите в систему в качестве пользователя с административными привилегиями.

  2. Выполните следующее в окне команды DOS.

    matlabroot\toolbox\distcomp\bin\addMatlabToWindowsFirewall.bat
    

    Эта команда добавляет MATLAB как позволенную программу. Если вы используете другие брандмауэры, необходимо сконфигурировать их для подобного размещения.

Подтвердите установку Используя Slurm, LSF, PBS Pro, или ЗАКРУТИТЕ планировщик

Эта процедура проверяет, что продукты параллельных вычислений установлены и сконфигурированы правильно на вашем кластере.

Шаг 1: задайте кластерный профиль

На этом шаге вы задаете кластерный профиль, чтобы использовать на последующих шагах.

  1. Запустите Кластерного менеджера по Профилю с рабочего стола MATLAB путем выбора на вкладке Home в области Environment Parallel> Manage Cluster Profiles.

  2. Создайте новый профиль в Кластерном менеджере по Профилю путем выбора New> LSF (или Slurm, PBS Pro или Torque, как соответствующего).

  3. С новым профилем, выбранным в списке, нажмите Rename и отредактируйте имя профиля, чтобы быть InstallTest. Нажмите Enter.

  4. Во вкладке Properties обеспечьте настройки для следующих полей:

    1. Установите поле Description на For testing installation.

    2. Установите JobStorageLocation на местоположение, где вы хотите, чтобы задание и данные о задаче хранились (доступный для всех машин рабочего, если у вас есть совместно используемая файловая система).

      Примечание

      JobStorageLocation не должен быть совместно использован продуктами параллельных вычислений, запускающими различные версии; каждая версия на вашем кластере должна иметь свой собственный JobStorageLocation.

    3. Установите поле NumWorkers на количество рабочих, вы хотите запустить тесты валидации на, в рамках ограничения вашего лицензирования.

    4. Установите ClusterMatlabRoot на местоположение установки MATLAB выполняться машинами рабочего, как определено в Главе 1 инструкций по установке.

    5. Установите SubmitArguments включать любые дополнительные аргументы команды, требуемые вашим конкретным кластером и планировщиком.

    6. Если вы используете LSF®, установите OperatingSystem на операционную систему ваших машин рабочего.

    7. Установите HasSharedFilesystem указывать, могут ли клиент и рабочие совместно использовать то же местоположение данных.

      Диалоговое окно должно выглядеть примерно так, или немного отличающийся для планировщиков КРУТЯЩЕГО МОМЕНТА или PBS Pro®.

  5. Нажмите Done, чтобы сохранить ваш кластерный профиль.

Шаг 2: подтвердите кластерный профиль

На этом шаге вы проверяете свой кластерный профиль, и таким образом свою установку. Можно задать количество рабочих, чтобы использовать при проверке профиля. Если вы не зададите количество рабочих во вкладке Validation, то валидация попытается использовать столько рабочих сколько значение, заданное свойством NumWorkers на вкладке Properties. Можно задать меньшее число рабочих, чтобы подтвердить настройку, не занимая целый кластер.

  1. Если это не уже открыто, запустите Кластерного менеджера по Профилю с рабочего стола MATLAB путем выбора на вкладке Home в Environment areaParallel> Manage Cluster Profiles.

  2. Выберите свой кластерный профиль в листинге.

  3. Кликните по вкладке Validation.

  4. Используйте флажки, чтобы выбрать все тесты или подмножество этапов валидации, и задать количество рабочих, чтобы использовать при проверке профиля.

  5. Нажмите Validate.

Вкладка Validation Results показывает вывод. Следующие данные показывают результаты профиля, который прошел все тесты валидации.

Примечание

Если ваша валидация не передает, свяжитесь со службой поддержки установки MathWorks.

Если ваша валидация передала, у вас теперь есть допустимый профиль, который можно использовать в других параллельных приложениях. Можно сделать любые модификации к профилю подходящими для приложений, таких как NumWorkersRange, AttachedFiles, AdditionalPaths, и т.д.

Чтобы сохранить ваш профиль для других пользователей, выберите профиль и нажмите Export, затем сохраните ваш профиль в файл в удобном месте. Позже, при выполнении Кластерного менеджера по Профилю, другие пользователи могут импортировать профиль путем нажатия на Import.

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте