Чтобы загрузить настройку в рабочую область MATLAB®, не загружая его в Report Explorer, используйте функцию rptgen.loadRpt.
Можно затем изменить настройку программно. Например, следующий код загружает настройку в память, устанавливает ее выходной тип на PDF и генерирует отчет.
setupRoot = rptgen.loadRpt('simple-report');
setupRoot.Format = 'pdf-fop';
setupRoot.execute;