Получите матрицу стехиометрии от объекта модели
M = getstoichmatrix(modelObj)
[M,objSpecies]
= getstoichmatrix(modelObj)
[M,objSpecies,objReactions]
= getstoichmatrix(modelObj)
M | Матрица стехиометрии для . |
| Задайте model object. |
| Возвратите список разновидностей |
| Возвратите список реакций |
getstoichmatrix возвращает матрицу стехиометрии для объекта модели.
возвращает матрицу стехиометрии для объекта модели SimBiology® (M = getstoichmatrix(modelObj)) к modelObj.M
Матрица стехиометрии задана путем листинга всех реакций, содержавших в по столбцам и всех разновидностей, содержавших в modelObj, построчном в матрице. Разновидности реакции представлены в матрице со стехиометрическим значением в местоположении [строка разновидностей, столбец реакции]. Реагенты имеют отрицательные величины. Продукты имеют положительные значения. Все другие местоположения в матрице 0.modelObj
Например, если является объектом модели с двумя реакциями с именами modelObjR1 и R2 и значения Реакции 2 A + B -> 3 C и B + 3 D -> 4 A, матрица стехиометрии была бы задана как:
R1 R2 A -2 4 B -1 -1 C 3 0 D 0 -3
[ возвращает матрицу стехиометрии в M,objSpecies]
= getstoichmatrix(modelObj) и разновидности к M. objSpecies задан путем листинга всех значений свойств objSpeciesName разновидностей, содержавших в . В вышеупомянутом примере Obj был бы objSpecies{'A', 'B', 'C', 'D'};.
[ возвращает матрицу стехиометрии в M,objSpecies,objReactions]
= getstoichmatrix(modelObj) и реакции на M. objReactions задан путем листинга всех значений свойств objReactionsName реакций, содержавших в . В вышеупомянутом примере modelObj был бы objReactions{'R1', 'R2'}.
Читайте в m1, объекте модели, с помощью sbmlimport:
m1 = sbmlimport('lotka.xml');Получите матрицу стехиометрии для m1:
[M,objSpecies,objReactions] = getstoichmatrix(m1)