sffinfo

Возвратите информацию о файле SFF

Синтаксис

InfoStruct = sffinfo(File)

Описание

InfoStruct = sffinfo(File) возвращает структуру MATLAB^®, содержащую итоговую информацию о файле Стандартного формата Flowgram (SFF).

Входные параметры

File

Вектор символов или строка, задающая имя файла или путь и имя файла файла SFF, производятся версией 1.0 Системного программного обеспечения анализа данных Секвенсера Генома от 454 Life Sciences^®. Если вы задаете только имя файла, тот файл должен быть на пути поиска файлов MATLAB или в текущей папке.

Выходные аргументы

InfoStruct

Структура MATLAB, содержащая итоговую информацию о файле SFF. Структура содержит следующие поля.

Поле	Описание
`Filename`	Имя файла.
`FileModDate`	Дата модификации файла.
`FileSize`	Размер файла в байтах.
`Version`	Номер версии файла.
`FlowgramCode`	Код формата раньше кодировал flowgram значения.
`NumberOfReads`	Количество последовательности читает в файле.
`NumberOfFlowsPerRead`	Количество потоков для каждого чтения.
`FlowChars`	Основы используются в каждом потоке.
`KeySequence`	Вектор символов основ в сочетании клавиш.

Примеры

Файл SFF, SRR013472.sff, используемый в этом примере не предоставлен программное обеспечение Bioinformatics Toolbox™. Можно загрузить демонстрационные файлы SFF с:

https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/

Возвратите сводные данные содержимого файла SFF:

info = sffinfo('SRR013472.sff')

info = 

                Filename: 'SRR013472.sff'
             FileModDate: '23-Feb-2009 15:14:36'
                FileSize: 6632392
                 Version: [0 0 0 1]
            FlowgramCode: 1
           NumberOfReads: 3546
    NumberOfFlowsPerRead: 440
               FlowChars: [1x440 char]
             KeySequence: 'TCAG'

Внешние веб-сайты

https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/

Представленный в R2009b

Документация Bioinformatics Toolbox

Поддержка

Памятка переводчика

1. Если смысл перевода понятен, то лучше оставьте как есть и не придирайтесь к словам, синонимам и тому подобному. О вкусах не спорим.

2. Не дополняйте перевод комментариями “от себя”. В исправлении не должно появляться дополнительных смыслов и комментариев, отсутствующих в оригинале. Такие правки не получится интегрировать в алгоритме автоматического перевода.

3. Сохраняйте структуру оригинального текста - например, не разбивайте одно предложение на два.

4. Не имеет смысла однотипное исправление перевода какого-то термина во всех предложениях. Исправляйте только в одном месте. Когда Вашу правку одобрят, это исправление будет алгоритмически распространено и на другие части документации.

5. По иным вопросам, например если надо исправить заблокированное для перевода слово, обратитесь к редакторам через форму технической поддержки.

Документация