Класс: термин
Имя представления вектора символов только для чтения ИДЕТ термин
name свойство только для чтения термина класс. name вектор символов, представляющий имя ПОЙТИ термина.
Возможные значения являются любым именем, используемым в термине в базе данных Gene Ontology. Используйте name свойство определить имена объектов термина, или получить доступ или отфильтровать объекты термина по наименованию.
Загрузите текущую версию базы данных Gene Ontology с сети в объект geneont в MATLAB.
GeneontObj = geneont('LIVE', true)Программное обеспечение MATLAB создает объект geneont и отображает количество объектов термина, сопоставленных с объектом geneont.
Gene Ontology object with 27769 Terms.
Отобразите имя термина объект в 157-м положении в объекте geneont, GeneontObj.
GeneontObj.terms(157).name ans = cytosolic small ribosomal subunit
Если вы знаете ПОЙТИ идентификатор (например, 181) объекта термина, вместо его индекса или номера положения (например, 157), можно использовать следующий синтаксис, чтобы отобразить имя объекта термина:
GeneontObj(181).terms.name
Для справки, преобразующей индекс или количество положения объекта термина к ИДТИ идентификатор, смотрите term.id свойство.
Найдите индекс или количество положения термина объект чей name свойством является 'membrane'.
membrane_index = find(strcmp(get(GeneontObj.terms,'name'),'membrane'))
membrane_index =
9556Используйте этот индекс или номер положения и id свойство определить ПОЙТИ идентификатор термина объект.
membrane_goid = GeneontObj.terms(membrane_index).id
membrane_goid =
16020Используйте это ПЕРЕХОДИТ идентификатор, как введено к getrelatives метод, чтобы найти ПОЙТИ идентификаторы других объектов термина, которые являются мгновенными родственниками термина объект чей name свойством является 'membrane'.
relative_ids = getrelatives(GeneontObj,membrane_goid)
relative_ids =
5628
5886
16020
19867
30673
31090
34045
34357
42175
42622
42734
44464
45211
48475
60342Перечислите name свойства этих объектов термина.
get(GeneontObj(relative_ids).terms,'name')
ans =
'prospore membrane'
'plasma membrane'
'membrane'
'outer membrane'
'axolemma'
'organelle membrane'
'pre-autophagosomal structure membrane'
'photosynthetic membrane'
'nuclear envelope-endoplasmic reticulum network'
'photoreceptor outer segment membrane'
'presynaptic membrane'
'cell part'
'postsynaptic membrane'
'coated membrane'
'photoreceptor inner segment membrane'