Exponenta Banner

Создайте новый ряд DICOM

При записи модифицированного изображения в файл DICOM вы можете хотеть сделать модифицированное изображение запуском нового ряда. В стандарте DICOM изображения могут быть организованы в ряд. Когда вы пишете изображение с метаданными к файлу DICOM, dicomwrite помещает изображение в тот же ряд по умолчанию. Чтобы создать новый ряд, необходимо присвоить новый уникальный идентификатор DICOM SeriesInstanceUID поле метаданных. Следующий пример иллюстрирует этот процесс.

  1. Считайте изображение из файла DICOM в рабочую область MATLAB®.

    I = dicomread('CT-MONO2-16-ankle.dcm');

    Чтобы просмотреть изображение, используйте любую из функций отображения тулбокса imshow или imtool. Поскольку данные изображения DICOM подписываются 16-битные данные, необходимо использовать автомасштабирующийся синтаксис.

    imtool(I,'DisplayRange',[])

  2. Считайте метаданные из того же файла DICOM.

    info = dicominfo('CT-MONO2-16-ankle.dcm');

    Чтобы идентифицировать ряд, изображение принадлежит, просмотрите значение SeriesInstanceUID поле .

    info.SeriesInstanceUID
    ans =

1.2.840.113619.2.1.2411.1031152382.365.736169244

  3. Вы обычно только запускаете новую серию DICOM, когда вы изменяете изображение в некотором роде. Этот пример удаляет весь текст из изображения.

    Пример находит максимальные и минимальные значения всех пикселей в изображении. Пиксели, которые формируют белые текстовые символы, установлены в максимальное пиксельное значение.

    max(I(:))
    ans =

    4080
    min(I(:))
    ans =

    32

    Чтобы удалить эти текстовые символы, пример устанавливает все пиксели с максимальным значением к минимальному значению.

    Imodified = I;
Imodified(Imodified == 4080) = 32;

    Просмотрите обработанное изображение.

    imshow(Imodified,[])

  4. Сгенерируйте новый уникальный идентификатор DICOM (UID) с помощью dicomuid функция. Вам нужен новый UID, чтобы записать модифицированное изображение как новый ряд.

    uid = dicomuid
    uid =

1.3.6.1.4.1.9590.100.1.1.56461980611264497732341403390561061497

    dicomuid как гарантируют, сгенерирует уникальный UID.

  5. Установите значение SeriesInstanceUID поле в метаданных, сопоставленных с исходным файлом DICOM к сгенерированному значению.

    info.SeriesInstanceUID = uid;

  6. Запишите модифицированное изображение в новый файл DICOM, задав модифицированную структуру метаданных, info, в качестве аргумента. Поскольку вы устанавливаете SeriesInstanceUID значение, изображение, которое вы пишете, является частью нового ряда.

    dicomwrite(Imodified,'ankle_newseries.dcm',info);

    Чтобы проверить эту операцию, просмотрите изображение и SeriesInstanceUID поле метаданных в новом файле.

Для получения информации об изменениях синтаксиса, которые задают пространственные координаты не по умолчанию, смотрите страницу с описанием для imshow.

Документация Image Processing Toolbox
Поддержка