Класс: BioMap
Получите подпись (информация о выравнивании) от BioMap объект
Signature = getSignature(BioObj)
Signature = getSignature(BioObj, Subset)
Signature = getSignature(BioObj)Signature, массив ячеек отформатированных строк СИГАРЫ, каждое представление, как последовательность чтения в a BioMap объект выравнивается к ссылочной последовательности.
Signature = getSignature(BioObj, Subset), указанных Subset.
|
Объект |
|
Одно из следующих, чтобы задать подмножество элементов в
Примечание Если вы используете массив ячеек заголовков, чтобы задать |
|
|
Создайте a BioMap объект, и затем получает подписи для различных элементов в объекте:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve the signature property of the second element in
% the object
Sig_2 = getSignature(BMObj1, 2)Sig_2 =
'35M'% Retrieve the signature properties of the first and third % elements in the object Sig_1_3 = getSignature(BMObj1, [1 3])
Sig_1_3 =
'36M'
'35M'% Retrieve the signature properties of all elements in the object Sig_All = getSignature(BMObj1);
Альтернатива использованию getSignature метод должен использовать точечную индексацию с Signature свойство:
BioObj.Sgnature(Indices)
В предыдущем синтаксисе, Indices вектор из положительных целых чисел или логический вектор. Indices не может быть массив ячеек из символьных векторов или представить в виде строки вектор, содержащий заголовки последовательности.