Приложения SimBiology

Интерактивные приложения, чтобы упростить создание, симуляцию и анализ динамических систем

SimBiology обеспечивает набор интегрированных приложений, которые спроектированы, чтобы упростить создание, симуляцию и анализ моделей динамических систем, таких как количественная системная фармакология (QSP), фармакокинетическая/фармакодинамическая модели системной биологии и (PK/PD).

  • Приложение SimBiology Model Builder позволяет вам создать динамические модели в интерактивном режиме с помощью различных элементов моделирования. Например, можно смоделировать множество биологических систем, таких как сигнальные трассы, метаболические сети, PBPK, QSP и модели PK/PD. Это также позволяет вам биологическая изменчивость модели и различные режимы дозирования, чтобы исследовать различные экспериментальные условия и стратегии дозирования.

  • Приложение SimBiology Model Analyzer позволяет вам выполнить исследования моделей динамических систем. Можно симулировать динамическое поведение модели с помощью различных решателей и оценить параметры модели. Чтобы исследовать системную динамику и экспериментирование руководства, можно выполнить развертки параметра и анализ чувствительности.

Приложения

SimBiology Model BuilderСоздайте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии в интерактивном режиме
SimBiology Model AnalyzerАнализируйте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии

Темы

Создайте модели

Создайте модель кинетики лиганда приемника

В этом примере показано, как создать и симулировать простую модель кинетики лиганда приемника с помощью приложений SimBiology Model Analyzer и SimBiology Model Builder.

Включите ингибирование SGLT2 в физиологически основанную модель инсулина глюкозы Используя SimBiology Model Builder

Включите котранспортер глюкозы натрия 2 ингибирования приемника (SGLT2) гипотетическим составным объектом в существующую модель инсулина глюкозы.

Скопируйте блоки SimBiology

Скопируйте и вставьте блоки SimBiology при создавании моделей в Схеме.

Горячие клавиши для SimBiology Model Builder

Приложение SimBiology Model Builder обеспечивает горячие клавиши для различных действий моделирования.

Библиотеки компонента модели SimBiology

Библиотеки SimBiology® являются наборами встроенных компонентов, которые можно использовать, чтобы создать и анализировать модели.

Передайте значки индикатора в SimBiology Model Builder

Приложение SimBiology Model Builder использует контекстные значки, чтобы предоставить больше информации о компонентах модели в таблицах браузера и блоках во вкладке Diagram.

Анализируйте модели и данные

Вычислите Параметры NCA и Подбирайте Модель к Данным PK/PD Используя Приложение SimBiology Model Analyzer

Выполните неразделенный на отсеки анализ и калибруйте параметры модели путем подбора кривой к экспериментальным данным PKPD с помощью нелинейной регрессии.

Найдите важные параметры с анализом чувствительности Используя приложение SimBiology Model Analyzer

Выполните анализ чувствительности, чтобы найти важные параметры модели.

Биологическая изменчивость модели с виртуальными пациентами Используя приложение SimBiology Model Analyzer

Сгенерируйте демонстрационные значения для параметров модели, чтобы представлять виртуальных пациентов и симулировать, чтобы исследовать изменчивость модели.

Отсканируйте режимы дозирования Используя приложение SimBiology Model Analyzer

Исследуйте несколько объемов дозирования, которые соответствуют порогам эффективности и токсичности.

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте