Высокопроизводительное секвенирование
Экспрессия гена, транскрипционный фактор и анализ метилирования методов секвенирования следующего поколения (NGS), включая секвенирование РНК и CHiP-секвенирование
Высокопроизводительные методы секвенирования генерируют большие объемы данных и требуют устойчивых вычислительных аппаратов для последующего анализа. Bioinformatics Toolbox™ предоставляет алгоритмы, для анализа данных секвенирования следующего поколения (NGS), такие как фильтрация и обрезка показаний, сопоставление показаний и ссылок, подсчет количества чтений, сопоставленных с геномными функциями и выполнением статистического анализа.
Подсвеченные темы
- Импорт данных
Импортируйте данные о Секвенировании следующего поколения (NGS) и покажите аннотации от СЭМА, BAM, FASTA, FASTQ, GTF и файлов GFF
- Предварительная обработка
Управляйте данными NGS с синглом - и чтения парного конца, фильтр и обрежьте чтения и качественную статистику отображения
- Выравнивание
Сопоставьте чтения со ссылочной последовательностью (последовательностями)
- Статистический анализ
Считайте резюмирование и статистические анализы данных ЧИПА-seq и RNA-seq
- Визуализация
Визуализируйте выравнивание чтений к ссылочным последовательностям
