joinseq

Объединение двух последовательностей для создания кратчайшей сверхчлени

Синтаксис

SeqNT3 = joinseq(SeqNT1, SeqNT2)

Аргументы

SeqNT1, SeqNT2 Нуклеотидные последовательности. Введите символьный вектор или строку для каждой последовательности.

Описание

SeqNT3 = joinseq(SeqNT1, SeqNT2) создает новую последовательность, которая является самой короткой сверхпоследовательностью SeqNT1 и SeqNT2. Если между последовательностями нет перекрытия, то SeqNT2 сцеплен с концом SeqNT1. Если длина перекрытия одинакова на обоих концах последовательности, то перекрытие в конце SeqNT1 и начало SeqNT2 используется для соединения последовательностей.

Если SeqNT1 является подпоследовательностью SeqNT2, то SeqNT2 возвращается как самая короткая суперпоследовательность и наоборот.

Примеры

Объединение двух последовательностей, содержащих перекрытие.

seq1 = 'ACGTAAA';
seq2 = 'AAATGCA';
joined = joinseq(seq1,seq2)

joined =
    ACGTAAATGCA

См. также

cat | strcat | strfind

Представлен до R2006a

Документация по инструментарию биоинформатики

Поддержка

Памятка переводчика

1. Если смысл перевода понятен, то лучше оставьте как есть и не придирайтесь к словам, синонимам и тому подобному. О вкусах не спорим.

2. Не дополняйте перевод комментариями “от себя”. В исправлении не должно появляться дополнительных смыслов и комментариев, отсутствующих в оригинале. Такие правки не получится интегрировать в алгоритме автоматического перевода.

3. Сохраняйте структуру оригинального текста - например, не разбивайте одно предложение на два.

4. Не имеет смысла однотипное исправление перевода какого-то термина во всех предложениях. Исправляйте только в одном месте. Когда Вашу правку одобрят, это исправление будет алгоритмически распространено и на другие части документации.

5. По иным вопросам, например если надо исправить заблокированное для перевода слово, обратитесь к редакторам через форму технической поддержки.