Класс: SimBiology.export.Model
Моделирование экспортированной модели SimBiology
[t,x,names] = simulate(model)
[t,x,names] = simulate(model,initialValues)
[t,x,names] = simulate(model,initialValues,doses)
simDataObj = simulate(___)
[ моделирует модель, используя исходные значения по умолчанию, указанные t,x,names] = simulate(model)model.InitialValues (которые всегда равны InitialValue свойство на соответствующем ValueInfo объект). simulate возвращает:
t, временные выборки.
xданные моделирования, которые содержат изменение количества состояний во времени.
names, метки столбцов данных моделирования x.
С помощью свойства можно задать дополнительные параметры моделирования SimBiology.export.Model.SimulationOptions.
[ моделирует модель, используя значения, указанные в t,x,names] = simulate(model,initialValues)initialValues в качестве начальных значений моделирования.
[ моделирует модель, используя указанные исходные значения и дозы.t,x,names] = simulate(model,initialValues,doses)
simDataObj = simulate(___) возвращает данные моделирования в SimData object simDataObj с использованием любого из входных аргументов в предыдущих синтаксисах. simDataObj содержит данные о времени и состоянии, а также метаданные, такие как типы и имена сообщаемых состояний. Доступ к хранилищам времени, данных и имен можно получить в simDataObj использование свойств simDataObj.Time, simDataObj.Data, и simDataObj.DataNamesсоответственно.
|
|
|
Вектор значений для По умолчанию: значения, указанные в |
|
Вектор дозовых объектов с указанием доз, используемых для моделирования. Объекты входной дозы должны быть подмножеством доз в экспортируемой модели, возвращаемых По умолчанию: все дозовые объекты в экспортируемой модели. |
|
вектор n-на-1 отсчетов времени от моделирования, где n - количество отсчетов времени. |
|
n-by-m матрица данных моделирования, где n - количество отсчетов времени, а m - количество состояний, зарегистрированных во время моделирования. Каждый столбец |
|
Массив ячеек m-by-1 символьных векторов с именами, маркирующими строки и столбцы |
|
|
Загрузите образец объекта модели SimBiology и выберите вид y1 и y2 для моделирования.
modelObj = sbmlimport('lotka'); modelObj.getconfigset.RuntimeOptions.StatesToLog = ... sbioselect(modelObj,'Name',{'y1','y2'});
Экспорт объекта модели.
em = export(modelObj);
Моделирование экспортируемой модели.
[t,y] = simulate(em); figure() plot(t,y)
Измените исходные условия и смоделируйте снова.
xIndex = em.getIndex('x');
em.InitialValues(xIndex) = em.InitialValues(xIndex)*1.1;
[t,y] = simulate(em);
figure()
plot(t,y)