Не вызывайте ни один сеанс MATLAB® в отдельных потоках из файла MEX. MEX и Matrix Library API не являются многопоточными.
Можно создать потоки из файла MEX на C; однако доступ к MATLAB из этих потоков не поддерживается. Не вызывайте никаких функций MEX API из порожденных потоков, включая printf, который определяется как mexPrintf в mex.h заголовочный файл.
Для получения дополнительной информации смотрите Можно ли запускать новые потоки из файла MEX на C? в MATLAB Answers™.