Установите использование драйвера логгирования
H5P.set_fapl_log(fapl_id,logfile,flags,buf_size)
H5P.set_fapl_log(fapl_id,logfile,flags,buf_size) изменяет список свойств доступа к файлу, fapl_id, для использования H5FD_LOG драйвера регистрации. logfile - имя файла, в котором должны быть записаны записи в журнал. flags является битовой маской, которая задает типы активности для регистрации. Список доступных настроек флага см. в HDF5 документации. buf_size задает размер буфера регистрации.