exprprofvar

Вычислите отклонение профилей экспрессии гена

Синтаксис

Variance = exprprofvar(Data)
exprprofvar(..., 'PropertyName', PropertyValue,...)
exprprofvar(..., 'ShowHist', ShowHistValue)

Аргументы

Data

Объект DataMatrix или числовая матрица значений выражения, где каждая строка соответствует гену.

ShowHistValue

Управляет отображением гистограммы с данными об отклонении. Значение по умолчанию:

  • false — Когда выходные значения заданы.

  • true — Когда выходные значения не заданы.

Описание

Variance = exprprofvar(Data) вычисляет отклонение каждого профиля выражения в Data, объект DataMatrix или числовая матрица значений выражения, где каждая строка соответствует гену. Если вы не задаете выходные аргументы, эта функция отображает столбиковую диаграмму гистограммы области значений.

exprprofvar(..., 'PropertyName', PropertyValue,...) задает дополнительные свойства с помощью имени свойства / пары значения.

exprprofvar(..., 'ShowHist', ShowHistValue) управляет отображением гистограммы с данными об области значений. Выбор для ShowHistValue true или false.

Примеры

свернуть все

Загрузите микроданные массива, содержащие уровни экспрессии гена Saccharomyces cerevisiae (дрожжи).

load yeastdata

Этот MAT-файл включает три переменные, которые добавляются к рабочей области MATLAB®:

  • yeastvalues - Матрица A данных об экспрессии гена

  • гены - массив ячеек инвентарных номеров GenBank® для маркировки строк в yeastvalues

  • времена - вектор из временных стоимостей для маркировки столбцов в yeastvalues

Вычислите отклонение профилей выражения для данных о дрожжах, когда экспрессия гена изменяется во время метаболического сдвига от ферментации до дыхания. И отобразите гистограмму данных.

range = exprprofvar(yeastvalues,'ShowHist',true);

Figure contains an axes object. The axes object with title Profile Variances contains an object of type patch. This object represents absvar.

Смотрите также

| |

Представлено до R2006a