Считайте данные из файла NetCDF с помощью высокоуровневых функций, и затем считайте файл при помощи netcdf низкоуровневые функции пакета.
Сетевая Форма Общих данных (NETCDF) является набором библиотек программного обеспечения и машинно-независимых форматов данных, которые поддерживают создание, доступ и совместное использование ориентированных на массив научных данных. NetCDF используется широким спектром технических и научных полей, которые хотят стандартный способ хранить данные так, чтобы это могло быть совместно использовано.
MATLAB® высокоуровневые функции упрощают процесс импортирования данных из файла NetCDF или источника данных OPeNDAP NetCDF. Низкоуровневые функции MATLAB включают больше управления процессом импорта путем обеспечения доступа к стандартным программам в библиотеке NetCDF C. Чтобы использовать низкоуровневые функции эффективно, необходимо быть знакомы с Интерфейсом C NetCDF. Документация NetCDF доступна в веб-сайте Unidata.
Примечание
Для получения информации об импорте файлов Формата общих данных (CDF), которые имеют отдельный, несовместимый формат, смотрите Импорт файлов CDF с использованием низкоуровневых функций.
Это настоятельно рекомендовано это, вы связываете только с доверяемыми серверами OPeNDAP. В R2020b интерфейс MATLAB NetCDF соединяется только с доверяемыми конечными точками протокола доступа к данным (DAP) по умолчанию путем выполнения сертификата сервера и валидаций имени хоста. Ранее, когда вы получали доступ к серверу OPeNDAP, и сертификат сервера и валидация имени хоста были отключены по умолчанию.
Если требуется отключить сертификат сервера и валидацию имени хоста, добавьте следующую линию в .dodsrc файл в текущем каталоге:
[mylocaltestserver.lab] HTTP.SSL.VALIDATE=0
Это заставляет интерфейс MATLAB NetCDF связать с сервером OPeNDAP, имя которого задано в URI mylocaltestserver.lab не выполняя валидаций на сертификате сервера или имени хоста. Это изменение сохраняется в будущих сеансах работы с MATLAB. Для получения дополнительной информации об аутентификации сервера OPeNDAP и валидации имени хоста, смотрите Поддержку Авторизации NetCDF.
В этом примере показано, как отобразить и считать содержимое файла NetCDF, с помощью высокоуровневых функций.
Отобразите содержимое демонстрационного файла NetCDF, example.nc.
ncdisp('example.nc')Source:
\\matlabroot\toolbox\matlab\demos\example.nc
Format:
netcdf4
Global Attributes:
creation_date = '29-Mar-2010'
Dimensions:
x = 50
y = 50
z = 5
Variables:
avagadros_number
Size: 1x1
Dimensions:
Datatype: double
Attributes:
description = 'this variable has no dimensions'
temperature
Size: 50x1
Dimensions: x
Datatype: int16
Attributes:
scale_factor = 1.8
add_offset = 32
units = 'degrees_fahrenheight'
peaks
Size: 50x50
Dimensions: x,y
Datatype: int16
Attributes:
description = 'z = peaks(50);'
Groups:
/grid1/
Attributes:
description = 'This is a group attribute.'
Dimensions:
x = 360
y = 180
time = 0 (UNLIMITED)
Variables:
temp
Size: []
Dimensions: x,y,time
Datatype: int16
/grid2/
Attributes:
description = 'This is another group attribute.'
Dimensions:
x = 360
y = 180
time = 0 (UNLIMITED)
Variables:
temp
Size: []
Dimensions: x,y,time
Datatype: int16ncdisp отображения все группы, размерности и определения переменной в файле. Неограниченные размерности идентифицированы с меткой, UNLIMITED.
Считайте данные из peaks переменная.
peaksData = ncread('example.nc','peaks');
Отобразите информацию о peaksData вывод .
whos peaksDataName Size Bytes Class Attributes peaksData 50x50 5000 int16
Считайте description атрибут сопоставлен с переменной.
peaksDesc = ncreadatt('example.nc','peaks','description')
peaksDesc = z = peaks(50);
Создайте 3D объемную поверхностную диаграмму переменных данных. Используйте значение description припишите как заголовок фигуры.
surf(double(peaksData)) title(peaksDesc);
Считайте description атрибут сопоставлен с /grid1/ группа. Задайте название группы как второй вход к ncreadatt функция.
g = ncreadatt('example.nc','/grid1/','description')
g = This is a group attribute.
Считайте глобальный атрибут, creation_date. Для глобальных атрибутов задайте второй входной параметр к ncreadatt как '/'.
creation_date = ncreadatt('example.nc','/','creation_date')
creation_date = 29-Mar-2010
В этом примере показано, как найти все неограниченные размерности в группе в файле NetCDF, с помощью высокоуровневых функций.
Получите информацию о /grid2/ группа в файле примера, example.nc, использование ncinfo функция.
ginfo = ncinfo('example.nc','/grid2/')
ginfo =
Filename: '\\matlabroot\toolbox\matlab\demos\example.nc'
Name: 'grid2'
Dimensions: [1x3 struct]
Variables: [1x1 struct]
Attributes: [1x1 struct]
Groups: []
Format: 'netcdf4'
ncinfo возвращает массив структур, содержащий информацию о группе.
Получите вектор из булевых значений, которые указывают на неограниченные размерности для этой группы.
unlimDims = [ginfo.Dimensions.Unlimited]
unlimDims =
0 0 1Используйте unlimDims вектор, чтобы отобразить неограниченную размерность.
disp(ginfo.Dimensions(unlimDims))
Name: 'time'
Length: 0
Unlimited: 1
В этом примере показано, как получить информацию о размерностях, переменных и атрибутах в файле NetCDF с помощью низкоуровневых функций MATLAB в netcdf пакет. Чтобы использовать эти функции эффективно, необходимо быть знакомы с Интерфейсом C NetCDF.
Откройте файл NetCDF
Откройте демонстрационный файл NetCDF, example.nc, использование netcdf.open функция, с доступом только для чтения.
ncid = netcdf.open('example.nc','NC_NOWRITE')
ncid = 65536
netcdf.open возвращает идентификатор файла.
Получение информации о файле NetCDF
Получите информацию о содержимом файла с помощью netcdf.inq функция. Эта функция соответствует nc_inq функция в API библиотеки NetCDF C.
[ndims,nvars,natts,unlimdimID] = netcdf.inq(ncid)
ndims = 3
nvars = 3
natts = 1
unlimdimID = -1
netcdf.inq возвращает количество размерностей, переменных и глобальных атрибутов в файле, и возвращает идентификатор неограниченной размерности в файле. Неограниченная размерность может вырасти.
Получите имя глобального атрибута в файле с помощью netcdf.inqAttName функция. Эта функция соответствует nc_inq_attname функция в API библиотеки NetCDF C. Чтобы получить имя атрибута, необходимо задать ID переменной, атрибут сопоставлен с и номер атрибута. Чтобы получить доступ к глобальному атрибуту, который не сопоставлен с конкретной переменной, используют постоянный 'NC_GLOBAL' как идентификатор переменной.
global_att_name = netcdf.inqAttName(ncid,... netcdf.getConstant('NC_GLOBAL'),0)
global_att_name = 'creation_date'
Получите информацию о типе данных и длине атрибута с помощью netcdf.inqAtt функция. Эта функция соответствует nc_inq_att функция в API библиотеки NetCDF C. Снова, задайте идентификатор переменной с помощью netcdf.getConstant('NC_GLOBAL').
[xtype,attlen] = netcdf.inqAtt(ncid,... netcdf.getConstant('NC_GLOBAL'),global_att_name)
xtype = 2
attlen = 11
Получите значение атрибута, с помощью netcdf.getAtt функция.
global_att_value = netcdf.getAtt(ncid,... netcdf.getConstant('NC_GLOBAL'),global_att_name)
global_att_value = '29-Mar-2010'
Получите информацию о первой размерности в файле, с помощью netcdf.inqDim функция. Эта функция соответствует nc_inq_dim функция в API библиотеки NetCDF C. Второй вход к netcdf.inqDim ID размерности, который является основанным на нуле индексом, который идентифицирует размерность. Первая размерность имеет значение индекса 0.
[dimname,dimlen] = netcdf.inqDim(ncid,0)
dimname = 'x'
dimlen = 50
netcdf.inqDim возвращает имя и длину размерности.
Получите информацию о первой переменной в файле с помощью netcdf.inqVar функция. Эта функция соответствует nc_inq_var функция в API библиотеки NetCDF C. Второй вход к netcdf.inqVar идентификатор переменной, который является основанным на нуле индексом, который идентифицирует переменную. Первая переменная имеет значение индекса 0.
[varname,vartype,dimids,natts] = netcdf.inqVar(ncid,0)
varname = 'avagadros_number'
vartype = 6
dimids =
[]
natts = 1
netcdf.inqVar возвращает имя, тип данных, ID размерности и количество атрибутов, сопоставленных с переменной. Информация о типе данных возвращена в vartype числовое значение констант типа данных NetCDF, такой как, NC_INT и NC_BYTE. См. документацию NetCDF для получения информации об этих константах.
Считайте данные из файла NetCDF
Считайте данные, сопоставленные с переменной, avagadros_number, в файле в качестве примера, с помощью netcdf.getVar функция. Второй вход к netcdf.getVar идентификатор переменной, который является основанным на нуле индексом, который идентифицирует переменную. avagadros_number переменная имеет значение индекса 0.
A_number = netcdf.getVar(ncid,0)
A_number = 6.0221e+23
Просмотрите тип данных A_number.
whos A_numberName Size Bytes Class Attributes A_number 1x1 8 double
Функции в netcdf пакет автоматически выбирает класс MATLAB, что лучшие соответствия тип данных NetCDF, но можно также задать класс данных о возврате при помощи дополнительного аргумента к netcdf.getVar.
Считайте данные, сопоставленные с avagadros_number и возвратите данные как класс single.
A_number = netcdf.getVar(ncid,0,'single'); whos A_number
Name Size Bytes Class Attributes A_number 1x1 4 single
Закройте файл NetCDF
Закройте файл NetCDF, example.nc.
netcdf.close(ncid)
ncread | ncreadatt | ncdisp | ncinfo