Получите матрицу стехиометрии от объекта модели
Порядок разновидностей в выходных аргументах (M
и objSpecies
) совпадает с порядком разновидностей, возвращенных modelObj.Species
.
M
= getstoichmatrix(modelObj
)
[M
,objSpecies
]
= getstoichmatrix(modelObj
)
[M
,objSpecies
,objReactions
]
= getstoichmatrix(modelObj
)
M | Матрица стехиометрии для . |
| Задайте model object . |
| Возвратите список Если разновидности находятся в нескольких отсеках, имена разновидностей квалифицированы с именем отсека в форме |
| Возвратите список реакции Name свойство реакций. |
getstoichmatrix
возвращает матрицу стехиометрии для объекта модели.
возвращает матрицу стехиометрии для SimBiology® объект модели (M
= getstoichmatrix(modelObj
)
) к modelObj
.M
Матрица стехиометрии задана путем листинга всех реакций, содержавших в
по столбцам и все разновидности содержатся в modelObj
построчный в матрице. Разновидности реакции представлены в матрице со стехиометрическим значением в местоположении [строка разновидностей, столбец реакции]. Реагенты имеют отрицательные величины. Продукты имеют положительные значения. Все другие местоположения в матрице 0.modelObj
Например, если
объект модели с двумя реакциями с именами modelObj
R1
и R2
и значения Реакции 2 A + B -> 3 C
и B + 3 D -> 4 A
, матрица стехиометрии была бы задана как:
R1 R2 A -2 4 B -1 -1 C 3 0 D 0 -3
[
возвращает матрицу стехиометрии в M
,objSpecies
]
= getstoichmatrix(modelObj
)
и разновидности к M
. objSpecies
задан путем листинга всего objSpecies
Name
значения свойств разновидностей содержатся в
. В вышеупомянутом примере, Obj
был бы objSpecies
{'A', 'B', 'C', 'D'}
;.
[
возвращает матрицу стехиометрии в M
,objSpecies
,objReactions
]
= getstoichmatrix(modelObj
)
и реакции на M
. objReactions
задан путем листинга всего objReactions
Name
значения свойств реакций содержатся в
. В вышеупомянутом примере, modelObj
был бы objReactions
{'R1', 'R2'}
.
Читайте в m1
, объект модели, с помощью sbmlimport
:
m1 = sbmlimport('lotka.xml');
Получите матрицу стехиометрии для m1
:
[M,objSpecies,objReactions] = getstoichmatrix(m1)