SimBiology® имеет функциональность, которая помогает вам найти и зафиксировать предупреждения, что вы можете должны быть знать, и ошибки, которые препятствовали бы тому, чтобы вы симулировали и анализировали свою модель.
Верификация модели проверяет много аспектов модели включая:
Структура модели
Валидность математических выражений
Размерный анализ
Модульные проблемы преобразования
Можно проверять модель на предупреждения и ошибки в любое время при построении или работе с моделью. Например:
Проверьте свою модель во время конструкции, чтобы гарантировать, что модель завершена.
Проверьте модель после изменения настроек симуляции, размерных аналитических настроек или модульных настроек преобразования.
Анализирует, такие как симуляция, сканирование, и параметр, соответствующий автоматически, проверяет модель.
Совет
Неоднократно запуская задачу с помощью различного варианта или устанавливая различное значение для InitialAmount свойство разновидности, Capacity свойство отсека или Value свойство параметра, генерирует предупреждения только в первый раз, когда вы симулируете модель. Используйте функциональность верификации, описанную в этом разделе, чтобы вывести предупреждения снова.
Используйте verify метод, чтобы видеть список предупреждений и ошибок в вашей модели.
Используйте sbiolastwarning и sbiolasterror функции, чтобы возвратить последнее предупреждение и последнюю ошибку, с которой сталкиваются во время верификации.
Создайте модель с реакцией, это ссылается на K1, неопределенный параметр:
% Create a model named example model = sbiomodel('example'); % Add a compartment named cell to model compartment = addcompartment(model, 'cell'); % Add two species, A and B, to the cell compartment species_1 = addspecies(compartment, 'A'); species_2 = addspecies(compartment, 'B'); % Add the reaction A -> B to the model reaction = addreaction(model, 'A -> B', 'ReactionRate', 'K1');
Проверьте модель, чтобы проверять на предупреждения и ошибки:
verify(model)
??? --> Error reported from Expression Validation: The name 'K1' in reaction 'A -> B' does not refer to any in-scope species, parameters, or compartments.
Исправьте ошибку путем определения параметра K1:
% Add a parameter, K1, to the model with a value of 3 parameter = addparameter(model, 'K1', 3);
Проверьте модель снова:
verify(model)
Когда вы проверяете модель, можно просмотреть базовую систему уравнений модели. Просмотр уравнений модели полезен для:
Публикация целей
Отладка модели
Для получения дополнительной информации смотрите getequations или уравнения модели Show и начальные условия.