exprprofrange
Вычислите область значений профилей экспрессии гена
Синтаксис
Range = exprprofrange(Data)
[Range, LogRange] = exprprofrange(Data)
... = exprprofrange(Data,
'ShowHist', ShowHistValue)
Аргументы
Data | Объект DataMatrix или числовая матрица значений выражения, где каждая строка соответствует гену. |
ShowHistValue | Управляет отображением гистограммы с данными об области значений. Значение по умолчанию:
|
Описание
Range = exprprofrange(Data)Data, объекте DataMatrix или числовой матрице значений выражения, где каждая строка соответствует гену.
[ возвращает логарифмическую область значений, то есть, Range, LogRange] = exprprofrange(Data)log(max(prof))- log(min(prof)), каждого профиля выражения. Если вы не задаете выходные аргументы, exprprofrange отображает столбиковую диаграмму гистограммы области значений.
... = exprprofrange( управляет отображением гистограммы с данными об области значений. Выбором для Data,
'ShowHist', ShowHistValue)ShowHistValue является true или false.
Примеры
Вычислите область значений профилей экспрессии гена
Загрузите микроданные массива, содержащие уровни экспрессии гена Saccharomyces cerevisiae (дрожжи).
load yeastdataЭтот MAT-файл включает три переменные, которые добавляются к рабочей области MATLAB®:
yeastvalues- Матрица данных об экспрессии генагены - массив ячеек инвентарных номеров GenBank® для маркировки строк в yeastvalues
времена - вектор временных стоимостей для маркировки столбцов в yeastvalues
Вычислите область значений профилей выражения для данных о дрожжах, когда экспрессия гена изменяется во время метаболического сдвига от ферментации до дыхания. И отобразите гистограмму данных.
range = exprprofrange(yeastvalues,'ShowHist',true);