mzxmlinfo

Возвратите информацию о mzXML файле

Синтаксис

InfoStruct = mzxmlinfo(File) InfoStruct = mzxmlinfo(File, 'NumOfLevels', NumOfLevelsValue)

Входные параметры

File

Вектор символов или строка, содержащая имя файла, или путь и имя файла, mzXML файла, который соответствует спецификации mzXML 2.1 или более ранним спецификациям.

Если вы задаете только имя файла, тот файл должен быть на пути поиска файлов MATLAB^® или в текущей папке.

NumOfLevelsValue

Управляет возвратом NumOfLevels, дополнительного поля в InfoStruct, который содержит количество уровней масс-спектрометрии (MS) спектров в File. Выбором является true или false (значение по умолчанию).

Выходные аргументы

InfoStruct

Структура MATLAB, содержащая информацию из mzXML файла. Это включает поля, показанные в приведенную ниже таблицу.

Описание

InfoStruct = mzxmlinfo(File) возвращает структуру MATLAB, InfoStruct, содержа итоговую информацию о mzXML файле, File.

File является вектором символов или строкой, содержащей имя файла, или путь и имя файла, mzXML файла. Файл должен соответствовать спецификации mzXML 2.1 или более ранним спецификациям. Можно просмотреть спецификацию mzXML 2.1 в:

http://sashimi.sourceforge.net/schema_revision/mzXML_2.1/Doc/mzXML_2.1_tutorial.pdf

InfoStruct включает следующие поля.

Поле	Описание
`Filename`	Имя mzXML файла.
`FileModDate`	Дата модификации файла.
`FileSize`	Размер файла в байтах.
`NumberOfScans`	Количество сканирований в файле.*
`StartTime`	Запустите время начала.*
`EndTime`	Запустите время окончания.*
`DataProcessingIntensityCutoff`	Минимальная масса / заряд (m/z) значение интенсивности.*
`DataProcessingCentroided`	Указывает, являются ли данные центроидом.*
`DataProcessingDeisotoped`	Указывает, являются ли данные deisotoped.*
`DataProcessing ChargeDeconvoluted`	Указывает, являются ли данные deconvoluted.*
`DataProcessingSpotIntegration`	Для экспериментов LC/MALDI, указывает, был ли peaks, элюирующий по нескольким местам, интегрирован в одно место.*

Поля * — These содержат N/A, если mzXML файл не включает связанные атрибуты. Связанные атрибуты являются дополнительными в mzXML файле на спецификацию mzXML 2.1.

InfoStruct = mzxmlinfo(File, 'NumOfLevels', NumOfLevelsValue) управляет возвратом NumOfLevels, дополнительного поля в mzXMLInfo, который содержит количество уровней масс-спектрометрии спектров в File. Выбором является true или false (значение по умолчанию).

Примеры

Примечание

В следующем примере файл не обеспечивается results.mzxml. Выборка mzXML файлы может быть найдена в:

Возвратите структуру MATLAB, содержащую итоговую информацию о mzXML файле.

info = mzxmlinfo('results.mzxml');

info = 

                            Filename: 'results.mzxml'
                         FileModDate: '07-May-2008 13:39:12'
                            FileSize: 10607
                       NumberOfScans: 2
                           StartTime: 'PT0.00683333S'
                             EndTime: 'PT200.036S'
       DataProcessingIntensityCutoff: 'N/A'
            DataProcessingCentroided: 'false'
            DataProcessingDeisotoped: 'N/A'
    DataProcessingChargeDeconvoluted: 'N/A'
       DataProcessingSpotIntegration: 'N/A'

Возвратите структуру MATLAB, содержащую итоговую информацию, включая количество уровней масс-спектрометрии, о mzXML файле.

info = mzxmlinfo('results.mzxml','numoflevels',true);

info = 

                            Filename: 'results.mzxml'
                         FileModDate: '07-May-2008 13:39:12'
                            FileSize: 10607
                       NumberOfScans: 2
                           StartTime: 'PT0.00683333S'
                             EndTime: 'PT200.036S'
       DataProcessingIntensityCutoff: 'N/A'
            DataProcessingCentroided: 'false'
            DataProcessingDeisotoped: 'N/A'
    DataProcessingChargeDeconvoluted: 'N/A'
       DataProcessingSpotIntegration: 'N/A'
                    NumberOfMSLevels: 2

Смотрите также

mzxmlread

Документация