Exponenta Banner

назовите свойство

Класс: термин

Имя представления вектора символов только для чтения ИДЕТ термин

Описание

name является свойством только для чтения термина класс. name является вектором символов, представляющим имя ПОЙТИ термина.

Значения

Возможные значения являются любым именем, используемым для термина в базе данных Gene Ontology. Используйте свойство name определить имена объектов термина, или получить доступ или отфильтровать объекты термина по наименованию.

Примеры

Пример 99. Используя имя Свойство Определить Имя Объекта термина

  1. Загрузите текущую версию базы данных Gene Ontology с сети в объект geneont в MATLAB.

    GeneontObj = geneont('LIVE', true)

    Программное обеспечение MATLAB создает объект geneont и отображает количество объектов термина, сопоставленных с объектом geneont. 

    Gene Ontology object with 27769 Terms.

  2. Отобразите имя термина объект в 157-м положении в объекте geneont, GeneontObj.

    GeneontObj.terms(157).name

ans =

  cytosolic small ribosomal subunit

Совет

Если вы знаете ПОЙТИ идентификатор (например, 181) объекта термина, вместо его индекса или номера положения (например, 157), можно использовать следующий синтаксис, чтобы отобразить имя объекта термина:

GeneontObj(181).terms.name

Для справки, преобразовывающей индекс или количество положения объекта термина к ИДТИ идентификатор, смотрите свойство term.id.

Пример 100. Используя имя Свойство Найти и Отобразить Объекты Конкретного термина

  1. Найдите индекс или количество положения термина объект, свойством name которого является 'membrane'.

    membrane_index = find(strcmp(get(GeneontObj.terms,'name'),'membrane'))

membrane_index =

        9556

  2. Используйте этот индекс или номер положения и свойство id определить ПОЙТИ идентификатор термина объект.

    membrane_goid = GeneontObj.terms(membrane_index).id

membrane_goid =

       16020

  3. Используйте это ПЕРЕХОДИТ идентификатор, как введено к методу getrelatives, чтобы найти ПОЙТИ идентификаторы других объектов термина, которые являются мгновенными родственниками термина объект, свойством name которого является 'membrane'.

    relative_ids = getrelatives(GeneontObj,membrane_goid)

relative_ids =

        5628
        5886
       16020
       19867
       30673
       31090
       34045
       34357
       42175
       42622
       42734
       44464
       45211
       48475
       60342

  4. Перечислите свойства name этих объектов термина. 

    get(GeneontObj(relative_ids).terms,'name')

ans = 

    'prospore membrane'
    'plasma membrane'
    'membrane'
    'outer membrane'
    'axolemma'
    'organelle membrane'
    'pre-autophagosomal structure membrane'
    'photosynthetic membrane'
    'nuclear envelope-endoplasmic reticulum network'
    'photoreceptor outer segment membrane'
    'presynaptic membrane'
    'cell part'
    'postsynaptic membrane'
    'coated membrane'
    'photoreceptor inner segment membrane'
Документация Bioinformatics Toolbox
Поддержка