Exponenta Banner

свойство синонима

Класс: термин

Массив только для чтения, содержащий, ИДЕТ условия, которые являются синонимами этого, ИДУТ термин

Описание

synonym является свойством только для чтения термина класс. synonym является массивом 2D ячейки столбца, содержащим, ИДУТ условия, которые являются синонимами этого, ИДУТ термин. Первый столбец содержит вектор символов, задающий тип синонима, такого как 'exact_synonym', 'related_synonym', 'broad_synonym', 'narrow_synonym' или 'alt_id'. Второй столбец содержит ПОЙТИ идентификатор синонимичного термина или вектора символов, описывающего синонимичный термин.

Значения

Возможные значения являются идентификаторами, ИДУТ условия от базы данных Gene Ontology. Используйте свойство synonym определить, ИДУТ идентификаторы синонимичных объектов термина.

Примеры

Пример 106. Используя Свойство синонима Определить Синонимичные Объекты термина

  1. Загрузите текущую версию базы данных Gene Ontology с сети в объект geneont в MATLAB.

    GeneontObj = geneont('LIVE', true)

    Программное обеспечение MATLAB создает объект geneont и отображает количество объектов термина, сопоставленных с объектом geneont. 

    Gene Ontology object with 27769 Terms.

  2. Отобразите термин объекты, которые синонимичны с термином объект в третьем положении в объекте geneont, GeneontObj.

    synonyms = GeneontObj.terms(3).synonym

synonyms = 

    'alt_id'           'GO:0019952'
    'alt_id'           'GO:0050876'
    'exact_synonym'     [1x39 char]

  3. Поскольку точный синоним не делает попытку перечисленный идентификатор, отображает текст этого синонима.

    synonyms(3,2)

ans = 

    '"reproductive physiological process" []'

  4. Отобразите термин объекты, которые синонимичны с термином объект в 352-м положении в объекте geneont, GeneontObj.

    GeneontObj.terms(352).synonym

ans = 

    'alt_id'             'GO:0006374'        
    'alt_id'             'GO:0006375'        
    'related_synonym'             [1x26 char]
    'related_synonym'             [1x26 char]
    'narrow_synonym'              [1x51 char]
    'narrow_synonym'              [1x50 char]
    'broad_synonym'      '"mRNA splicing" []'
    'broad_synonym'               [1x22 char]

Совет

Если вы знаете ПОЙТИ идентификатор (например, 398) объекта термина, вместо его индекса или номера положения (например, 352), можно использовать следующий синтаксис, чтобы отобразить синоним объекта термина:

GeneontObj(398).terms.synonym

Для справки, преобразовывающей индекс или количество положения объекта термина к ИДТИ идентификатор, смотрите свойство term.id.

Документация Bioinformatics Toolbox
Поддержка