Bioinformatics Toolbox™ предоставляет алгоритмы и приложения для Упорядочивания следующего поколения (NGS), анализа микромассивов, масс-спектрометрии и генной онтологии. Используя функции тулбокса, можно считать геномные и протеомные данные из стандартных форматов файлов, таких как СЭМ, FASTA, CEL и CDF, а также от онлайновых баз данных, таких как Автобус Экспрессии гена NCBI и GenBank®. Можно исследовать и визуализировать эти данные с браузерами последовательности, пространственными тепловыми картами и clustergrams. Тулбокс также предоставляет статистические методы для обнаружения peaks, приписывания значений для недостающих данных и выбора функций.
Можно объединить функции тулбокса, чтобы поддержать общие рабочие процессы биоинформатики. Можно использовать данные ЧИПА-Seq, чтобы идентифицировать транскрипционные факторы; анализируйте данные RNA-Seq, чтобы идентифицировать дифференцированно выраженные гены; идентифицируйте варианты номера копии и SNPs в данных микромассивов; и классифицируйте профили белка с помощью данных о масс-спектрометрии.
Анализ Упорядочивания Следующего поколения и браузер
Анализ последовательности и визуализация, включая попарный и несколько упорядочивают выравнивание и пиковое обнаружение
Анализ микроданных массива, включая чтение, фильтрацию, нормализацию и визуализацию
Анализ масс-спектрометрии, включая предварительную обработку, классификацию и идентификацию маркера
Филогенетический древовидный анализ
Функции теории графов, включая карты взаимодействия, графики иерархии и трассы
Данные импортируют из геномного, протеомного, и файлы экспрессии гена, включая СЭМА, FASTA, CEL и CDF, и от баз данных, таких как NCBI и GenBank
