Сравните целые геномы для организмов, который позволяет вам сравнивать организмы в совсем другом разрешении относительно одного генных сравнений. Вместо того, чтобы только фокусироваться на различиях между гомологичными генами можно получить сведения о крупномасштабных функциях геномной эволюции.

Создайте файл с отображенной памятью для данных о последовательности и работайте с ними, не загружая всю геномную последовательность в память. Целые геномы доступны человеку, мыши, крысе, fugu, и нескольким другим образцовым организмам. Для многих из этих организмов одна хромосома может составить несколько сотен миллионов пар оснований долго. Работа с такими большими наборами данных может быть сложной, когда можно столкнуться с ограничениями аппаратного и программного обеспечения, которое вы используете. Этот пример показывает один способ работать вокруг этих ограничений в MATLAB®.

Протестируйте данные RNA-Seq на дифференцированно выраженные гены с помощью отрицательной биномиальной модели.