Этот пример показывает, как исследовать 3-D маркированные объемные данные с помощью приложения Volume Viewer. Используя приложение, можно просмотреть маркированный объем отдельно или просмотреть метки как наложение на объеме интенсивности. Чтобы проиллюстрировать, пример загружает объем интенсивности, который показывает человеческий мозг с маркированными областями, которые показывают местоположение и тип опухолей, найденных в мозгу.
Эта часть примера показывает, как загрузить маркированный объем и объем интенсивности в Volume Viewer.
Загрузите данные об интенсивности MRI человеческого мозга и маркированного объема из MAT-файлов в рабочую область. Эта операция создает две переменные в рабочей области: vol и label.
load(fullfile(toolboxdir('images'),'imdata','BrainMRILabeled','images','vol_001.mat')); load(fullfile(toolboxdir('images'),'imdata','BrainMRILabeled','labels','label_001.mat')); whos
Name Size Bytes Class Attributes label 240x240x155 8928000 uint8 vol 240x240x155 17856000 uint16
Откройте приложение Volume Viewer. От полосы Инструмента MATLAB® откройте вкладку Apps и при Обработке изображений и Компьютерном зрении, щелкните
. Можно также открыть приложение с помощью команды volumeViewer.
Загрузите маркированный объем в приложение Volume Viewer. Нажмите Import Labeled Volume, чтобы открыть маркированный объем. Можно загрузить изображение в имени файла или загрузить переменную из рабочей области. (Если у вас есть объемные данные в формате DICOM, который использует несколько файлов, чтобы представлять объем, можно задать имя папки DICOM.) В данном примере выбирают опцию the Import From Workspace.
Выберите переменную рабочей области, сопоставленную с маркированными данными об объеме в диалоговом окне Import from Workspace, и нажмите OK.
В этой части примера вы просматриваете маркированные данные об объеме в Volume Viewer.
Просмотрите маркированный объем в приложении Volume Viewer. По умолчанию Volume Viewer отображает данные как маркированный объем, но можно также просмотреть его как плоскости разбиения. Чтобы исследовать маркированный объем, увеличьте и уменьшите масштаб на изображении с помощью колеса мыши или щелчка правой кнопкой. Можно также вращать объем путем расположения курсора в окно изображения, нажатия и содержания мыши и перемещения курсора. Вы всегда масштабируете или вращаетесь вокруг центра объема. Положение осей в окне Orientation Axes отражает ориентацию в пространстве маркированного объема, когда вы вращаете его.
Совершенствуйте свое представление маркированного объема с помощью части Rendering Editor Volume Viewer. Можно использовать Rendering Editor, чтобы просмотреть определенные метки и скрыть других, изменить цвет и изменить прозрачность меток. Маркируйте 000, фон, и это обычно не видимо. Когда вы выбираете фоновую метку, флажок Show Labels ясен по умолчанию. Чтобы выбрать все видимые метки целиком, выберите фоновую метку и нажмите Invert Selection. Чтобы изменить цвет метки (или всех меток), выберите метку в Rendering Editor и задайте цвет в селекторе Color. Можно также управлять прозрачностью метки с помощью ползунка Opacity.
В этой части примера вы просматриваете маркированный объем и объем интенсивности в Volume Viewer одновременно. Просмотр маркированного объема, наложенного на объеме интенсивности, может обеспечить контекст для данных.
С маркированным объемом уже в Volume Viewer, загрузите объем интенсивности в приложение. Нажмите Import Volume и выберите опцию Import From Workspace.
Выберите переменную рабочей области, сопоставленную с объемом интенсивности в диалоговом окне Import from Workspace, и нажмите OK.
Volume Viewer отображает маркированный объем по интенсивности объемные данные. По умолчанию Volume Viewer отображает данные о метке и данные об интенсивности как объемы, но можно также просмотреть его как плоскости разбиения. Чтобы исследовать маркированный и объемы интенсивности, увеличьте и уменьшите масштаб использования колеса мыши или щелчка правой кнопкой. Можно также вращать объемы путем расположения курсора в окно изображения, нажатия и содержания мыши и перемещения курсора. Чтобы просмотреть только объем интенсивности и скрыть маркированный объем, нажимают View Volume.
Совершенствуйте свое представление маркированного объема и объема интенсивности с помощью опций в Rendering Editor. Чтобы только просмотреть маркированный объем и скрыть объем интенсивности, снимают флажок Embed Labels in Volume. В области Labels Rendering Editor можно выбрать любую из меток и изменить его цвет или прозрачность. Маркируйте 000, фон. По умолчанию фон установлен в черный цвет и не видим. Флажок Show Labels ясен. Чтобы выбрать все метки, нажмите на фон и затем нажмите Invert Selection. Если объем интенсивности видим, можно изменить пороговое значение и прозрачность с помощью ползунков в области Volume Rendering Editor.
