Подтвердите и проверьте модель SimBiology
verify(modelObj)verify(modelObj,csObj)verify(modelObj,dvObj)verify(modelObj,csObj,dvObj)verify(modelObj,csObj,variantObj,doseObj)verify( выполняет проверки на
modelObj)modelObj Model, чтобы проверить, что можно моделировать модель. Эта функция генерирует сложенные ошибки и предупреждения, если она находит какие-либо проблемы. Чтобы видеть целый список ошибок и предупреждений, используйте sbiolasterror и sbiolastwarning. Функция использует активную конфигурацию модели, любые активные дозы и активные варианты для верификации.
verify( проверяет модель modelObj,dvObj)modelObj с помощью доз или вариантов, заданных dvObj и активным configset. dvObj может быть одним из следующего:
Массив доз или вариантов
Если вы устанавливаете dvObj освобождать [], функция использует активный configset, активные варианты и активные дозы.
Если вы задаете dvObj как варианты, функция использует заданные варианты и активные дозы. Любые другие варианты проигнорированы.
Если вы задаете dvObj как дозы, функция использует заданные дозы и активные варианты. Любые другие дозы проигнорированы.
verify( проверяет модель modelObj,csObj,dvObj)modelObj с помощью configset объекта csObj и доз или вариантов, заданных dvObj.
Если вы устанавливаете csObj на [], то функция использует активный объект configset.
Если вы устанавливаете dvObj на [], то функция не использует вариантов, но использует активные дозы.
Если вы задаете dvObj как варианты, функция использует заданные варианты и активные дозы. Любые другие варианты проигнорированы.
Если вы задаете dvObj как дозы, функция использует заданные дозы и активные варианты. Любые другие дозы проигнорированы.
verify( проверяет модель modelObj,csObj,variantObj,doseObj)modelObj с помощью configset объекта csObj, варианты (variantObj) и дозы (doseObj). Любой другой configset, дозы и варианты проигнорированы.
Если вы устанавливаете csObj на [], то функция использует активный объект configset.
Если вы устанавливаете variantObj на [], то функция не использует вариантов.
Если вы устанавливаете doseObj на [], то функция не использует доз.
Загрузите демонстрационную модель SimBiology.
sbioloadproject radiodecay.sbprojДобавьте новую конфигурацию модели с помощью различного времени остановки 15 секунд.
csObj = addconfigset(m1,'newStopTimeConfigSet');
csObj.StopTime = 15;Проверьте модель при использовании объекта configset.
verify(m1,csObj);
После верификации проверяйте последние ошибки и предупреждения, если существует кто-либо.
sbiolasterror
ans =
[]
sbiolastwarning
ans =
[]
Моделируйте модель.
sim = sbiosimulate(m1,csObj); sbioplot(sim);
Загрузите демонстрационную модель SimBiology.
sbioloadproject radiodecay.sbprojПолучите конфигурацию модели по умолчанию из модели.
defaultConfigSet = getconfigset(m1,'default');Добавьте запланированную дозу 100 молекул в 2 секунды для разновидностей x.
dObj = adddose(m1,'d1','schedule'); dObj.Amount = 100; dObj.AmountUnits = 'molecule'; dObj.TimeUnits = 'second'; dObj.Time = 2; dObj.TargetName = 'unnamed.x';
Проверьте модель при использовании значения по умолчанию configset объектный и добавленный объект дозы.
verify(m1,defaultConfigSet,dObj);
После верификации проверяйте последние ошибки и предупреждения, если существует кто-либо.
sbiolasterror
ans =
[]
sbiolastwarning
ans = struct with fields:
Type: 'Warning'
MessageID: 'SimBiology:odebuilder:SENSITIVITY_OUTPUTS_WITH_REPEATED_ASSIGNMENT_VARIABLES'
Message: 'The SensitivityAnalysisOptions Outputs property contains objects that are set by repeated assignment rules. Sensitivity analysis cannot currently be performed for these objects. No sensitivities will be computed....'
Моделируйте модель с помощью того же configset и объектов дозы.
sim = sbiosimulate(m1,defaultConfigSet,dObj);
Постройте результат.
sbioplot(sim);
Загрузите демонстрационную модель SimBiology.
sbioloadproject radiodecay.sbprojДобавьте новую конфигурацию модели с помощью различного времени остановки 15 секунд.
csObj = m1.addconfigset('newStopTimeConfigSet');
csObj.StopTime = 15;Добавьте запланированную дозу 100 молекул в 2 секунды для разновидностей x.
dObj = adddose(m1,'d1','schedule'); dObj.Amount = 100; dObj.AmountUnits = 'molecule'; dObj.TimeUnits = 'second'; dObj.Time = 2; dObj.TargetName = 'unnamed.x';
Добавьте вариант разновидностей x с помощью различной начальной суммы 500 молекул.
vObj = addvariant(m1,'v1'); addcontent(vObj,{'species','x','InitialAmount',500});
Проверьте модель при использовании configset, дозы и различных объектов. Обратите внимание на то, что порядок аргументов должен быть как описан.
verify(m1,csObj,vObj,dObj);
После верификации проверяйте последние ошибки и предупреждения, если существует кто-либо.
sbiolasterror
ans =
[]
sbiolastwarning
ans =
[]
Моделируйте модель с помощью того же configset, варианта и объектов дозы.
sim = sbiosimulate(m1,csObj,vObj,dObj);
Постройте результат.
sbioplot(sim);
