Рабочий стол SimBiology® является пользовательским интерфейсом с набором интегрированных инструментов, которые разработаны, чтобы упростить создание, симуляцию и анализ моделей динамических систем. Это обеспечивает интерактивный интерфейс, чтобы создать модели и выполнить анализы модели, такие как симуляция, вычисление чувствительности и оценка параметра. Это позволяет, вы сохранить ваше моделирование работаете проектом SimBiology, который содержит модели, экспериментальные данные, задачи анализа модели и результаты задачи.
Модель SimBiology является набором количеств и математических выражений, которые представляют динамическую систему. Выражения описывают математические отношения среди количеств. Для получения дополнительной информации о моделях SimBiology, смотрите то, Что Модель?.
Рабочий стол позволяет вам создать такую динамическую модель в интерактивном режиме. Один подход соединяет графические блоки, которые представляют элементы моделирования, такие как количества и выражения. Также можно создать модель путем ввода выражений как строк, таких как A –> B, где A и B являются количествами, участвующими в процессе преобразования.
Если у вас есть модель, можно выполнить исследования ее. Например, можно моделировать модель, чтобы видеть ее динамическое поведение по курсу времени или исследовать биологическую изменчивость путем симуляции альтернативных сценариев. Можно также выполнить сканирования параметра и анализ чувствительности, чтобы исследовать влияние параметров модели и начальных условий на поведении модели. Чтобы помочь вам выполнить эти исследования, рабочий стол предоставляет встроенным скриптам названные задачи пользовательского интерфейса.
Можно импортировать данные курса времени на рабочий стол. Это обеспечивает инструменты для фильтрации и визуализации данных. После того, как импортированный, можно использовать данные, чтобы оценить параметры модели или выдержать сравнение с результатами симуляции.
Как вы создаете и анализируете модели, можно использовать встроенные компоненты от библиотек. Например, модульная библиотека обеспечивает модульную функциональность и имеет набор предопределенных модулей, которые можно использовать в модели. Чтобы помочь вам создать модели графически, рабочий стол предоставляет библиотеке блоков блоки, представляющие различные элементы моделирования. Пользовательские элементы могут быть добавлены к любой из этих библиотек. Для получения дополнительной информации смотрите Библиотеки.
Когда вы работаете над моделями и исследованиями, рабочий стол постоянно проверяет, существуют ли какие-либо ошибки или предупреждения, и указывает на них использующий индикаторы сообщения. Можно навести на каждый индикатор, чтобы видеть соответствующее предупреждающее сообщение или сообщение об ошибке.
Настройки позволяют вам настроить построение моделей и настройки отображения, настройки задачи и параметры поиска.