Этот пример показывает, как создать и применить вариант к модели белка G деформации дикого типа. Вариант представляет значение параметров для модели белка G деформации мутанта. Таким образом, когда вы моделируете модель, не применяя вариант, вы видите результаты для дикой деформации типа, и когда вы моделируете модель с вариантом, вы видите результаты для деформации мутанта. Этот пример использует модель, описанную в Модели Дрожжей Гетеротримерный Цикл Белка G.
Значением параметра kGd является 0.11 для деформации дикого типа и 0.004 для деформации мутанта. Чтобы представлять деформацию мутанта, вы сохраните альтернативное значение 0.004 для параметра kGd в различном объекте и примените этот вариант при симуляции модели.
Для получения информации о вариантах смотрите Варианты.
Загрузите проект gprotein.sbproj, который включает переменную m1, объект модели SimBiology®.
sbioloadproject gproteinМожно создать вариант исходной модели путем определения различного значения параметров для параметра kGd модели. Во-первых, добавьте вариант в объект модели m1.
v1 = addvariant(m1,'mutant_strain');Затем, добавьте параметр kGd со значением 0.004 к различному объекту v1.
addcontent(v1,{'parameter','kGd','Value',0.004});Моделируйте дикую модель типа.
[t,x,names] = sbiosimulate(m1);
Моделируйте модель деформации мутанта путем применения варианта.
[tV,xV,names] = sbiosimulate(m1,v1);
Постройте и сравните моделируемые результаты.
subplot(1,2,1) plot(t,x); legend(names); xlabel('Time'); ylabel('Amount'); title('Wild Type'); subplot(1,2,2) plot(tV,xV); legend(names); xlabel('Time'); ylabel('Amount'); title('Mutant Strain');
