exponenta event banner

Моделируйте ответы на биологическую изменчивость и дозы

Моделируйте биологическую изменчивость, чтобы сравнить вид животных, деформации или экспериментальные условия, и исследовать различные стратегии дозирования

Функции

sbiosimulateМодель Simulate SimBiology
createSimFunctionОбъект Create SimFunction
sbiodoseСоздайте объект дозы
adddoseДобавьте объект дозы смоделировать
sbiovariantСоздайте различный объект
addvariantДобавьте вариант в модель
sbiosteadystate Найдите устойчивое состояние модели SimBiology
sbioaccelerateПодготовьте объект модели к ускоренным симуляциям
sbiosampleparametersСгенерируйте параметры путем выборки ковариационной модели (требует программного обеспечения Statistics and Machine Learning Toolbox),
sbiosampleerrorДемонстрационная ошибка на основе ошибочной модели и добавляет шум в данные моделирования
sbioplotПостройте результаты симуляции в одной фигуре
sbiosubplotПостройте результаты симуляции в подграфиках
sbiotrellisОтобразите на графике данные или результаты симуляции в графике решетки
sbioensemblerunНесколько стохастических выполнений ансамбля модели SimBiology
sbioensembleplotПокажите результаты выполнения ансамбля с помощью 2D или 3-D графиков
sbioensemblestatsПолучите статистику от данных о выполнении ансамбля

Классы

SimFunction objectПодобный функции интерфейс, чтобы выполнить модели SimBiology
ScheduleDose objectЗадайте протокол дозирования препарата
RepeatDose objectЗадайте протокол дозирования препарата
Variant objectСохраните альтернативные значения компонента
SimData objectУстройство хранения данных данных моделирования
Configset objectИнформация о настройках решателя для симуляции модели
SolverOptionsЗадайте образцовые опции решателя
RuntimeOptionsОпции для регистрируемых разновидностей
CompileOptionsРазмерный анализ и модульные опции преобразования

Примеры и руководства

Моделируйте биологическую изменчивость дрожжей G цикл белка Используя деформации Дикого Типа и мутанта

Этот пример показывает, как создать и применить вариант к модели белка G деформации дикого типа.

Моделируйте модель ответа инсулина глюкозы с различными начальными условиями

Этот пример показывает, как моделировать ответы инсулина глюкозы для нормальных и диабетических предметов.

Концепции

Дозы

Используйте дозы, чтобы смоделировать различные режимы дозирования.

Варианты

Используйте варианты, чтобы сохранить альтернативные значения параметров и начальные условия модели.

Симуляция модели

Моделируйте динамические модели с помощью различных решателей.

Выбор решателя симуляции

SimBiology® использует функцию решателя, чтобы вычислить решения для системы дифференциальных уравнений в различных временных интервалах во время симуляции модели.

Ускорение симуляций модели и исследований

Ускорьте симуляцию или анализ путем преобразования модели в скомпилированный код С.

Поиск и устранение проблем

Проблемы симуляции Поиска и устранения проблем

Диагностируйте ошибки симуляции SimBiology, такие как допуск Интегрирования не ошибка, которой соответствуют, путем изменения решателя или допусков.

Выбор абсолютного допуска и относительного допуска к симуляции

SimBiology использует AbsoluteTolerance и RelativeTolerance, чтобы управлять точностью интегрирования во время симуляции.

Получение ОДУ от реакций

Для симуляции модели SimBiology выводит обыкновенные дифференциальные уравнения (ОДУ) от образцовых реакций с помощью принципов массового баланса.