clusterGroup

Выберите кластерную группу

свернуть все на странице

Синтаксис

clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim)
cgObj2 = clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim)
cgObj2 = clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim,'InfoOnly',tf_InfoOnly)
cgObj2 = clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim,'Color',colorChoice)

Описание

пример

clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim) выбирает и подсвечивает кластерную группу, заданную groupIndex вдоль строки или размерности столбца dim в окне Clustergram.

пример

cgObj2 = clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim) создает и возвращает объект cgObj2 кластерграммы для заданной кластерной группы. Этот синтаксис эквивалентен выбору Export Group to Workspace опция из контекстного меню после щелчка правой кнопкой по группе в окне Clustergram.

cgObj2 = clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim,'InfoOnly',tf_InfoOnly) задает, возвратить ли кластерную группу как структуру или объект кластерграммы.

cgObj2 = clusterGroup(cgObj1,groupIndex,dim,'Color',colorChoice) задает цвет, чтобы использовать, чтобы подсветить древовидную схему выбранной кластерной группы.

Примеры

свернуть все

Загрузите микроданные массива, содержащие некоторые измерения уровней экспрессии гена.

load filteredyeastdata

Создайте кластерграмму, возражают и отображают тепловую карту из данных об экспрессии гена.

cgo = clustergram(yeastvalues(1:30,:),'Standardize','Row')
Clustergram object with 30 rows of nodes and 7 columns of nodes.

Из командной строки используйте clusterGroup функционируйте, чтобы выбрать и подсветить кластер столбца Группы 4 в окне Clustergram.

cgroup4 = clusterGroup(cgo,4,'column')
Clustergram object with 30(30) rows of nodes and 4(7) columns of nodes.

Входные параметры

свернуть все

Объект Clustergram, заданный как clustergram объект.

Индекс группы для кластерной группы в cgObj1, заданный как положительное целое число.

Пример 4

Типы данных: double

Размерность кластерной группы, заданной как 'row' или 'column'.

Пример: 'row'

Типы данных: char

Отметьте, чтобы возвратить структуру вместо объекта кластерграммы, заданного как true или false.

Пример: true

Типы данных: логический

Цвет, чтобы подсветить древовидную схему выбранной кластерной группы, заданной как вектор символов или трехэлементный числовой вектор значений RGB. Например, чтобы использовать голубой, задайте [0 1 1]C, или 'cyan'.

Для получения дополнительной информации об определении цветов смотрите Параметры цвета.

Пример: 'red'

Типы данных: double | char

Выходные аргументы

свернуть все

Выбранная кластерная группа, возвращенная как объект кластерграммы или структура. Если вы задаете 'InfoOnly' как true, функция возвращает cgObj2 как структура.

Больше о

свернуть все

Параметры цвета

Следующие списки предопределенные цвета и их эквиваленты триплета RGB. Краткие названия и длинные имена являются векторами символов, которые задают один из восьми предварительно установленных цветов. Триплет RGB является трехэлементным вектором-строкой, элементы которого задают интенсивность красных, зеленых, и синих компонентов цвета; интенсивность должна быть в области значений [0 1].

Триплет RGB

Краткое название

Длинное имя

[1 1 0]

y

yellow

[1 0 1]

m

magenta

[0 1 1]

c

cyan

[1 0 0]

r

red

[0 1 0]

g

green

[0 0 1]

b

blue

[1 1 1]

w

white

[0 0 0]

k

black

Смотрите также

|

Представленный в R2009b

Документация Bioinformatics Toolbox
Поддержка
Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте