Sequence Viewer
Визуализируйте и в интерактивном режиме исследуйте биологические последовательности
Описание
Приложение Sequence Viewer позволяет вам визуализировать и исследовать последовательности нуклеотида или аминокислота.
Вы можете:
Импортируйте последовательности из баз данных NCBI или EMBL непосредственно.
Просмотрите и исследуйте различную информацию о последовательности (такую как ORFs и CDSs) и базовая статистика (такая как проценты основных количеств или количеств аминокислоты).
Просмотрите дополнительные и противоположные дополнительные последовательности и другие функции последовательности, такие как гены и экзоны.
Извлеките разделы кодирования белка последовательности нуклеотида и экспортируйте их в рабочую область MATLAB®.
Ищите характеристические слова или шаблоны последовательности с помощью регулярных выражений.
Откройте приложение Sequence Viewer
Панель инструментов MATLAB: На вкладке Apps, под Computational Biology, кликают по значку приложения.
Командная строка MATLAB: Введите
seqviewer.
Примеры
Откройте и просмотрите биологическую последовательность
Получите последовательность из базы данных GenBank®.
S = getgenbank('M10051');Загрузите последовательность в приложение Sequence Viewer.
seqviewer(S)
В качестве альтернативы можно нажать Sequence Viewer на вкладке Apps, чтобы открыть приложение и просмотреть биологическую последовательность S.
Закройте приложение.
seqviewer('close')