Уменьшайте все объекты до линий в 2D двухуровневом изображении или 3-D бинарном объеме
B = bwskel(___,'MinBranchLength',N)N из скелета. bwskel удаляет (сокращает) все ветви короче, чем заданная длина. bwskel вычисляет длину как количество пикселей в ветви, использующей с 8 возможностями соединения в 2D и с 26 возможностями соединения для 3-D.
Считайте 2D полутоновое изображение в рабочую область. Отобразите изображение. Предметы интереса являются темными потоками против светлого фона.
I = imread('threads.png');
imshow(I)
Скелетирование требует двухуровневого изображения, в котором приоритетными пикселями является 1 (белый) и фон 0 (черный). Чтобы сделать оригинальное изображение подходящим для скелетирования, возьмите дополнение изображения так, чтобы объекты были легки, и фон является темным. Затем binarize результат.
Icomplement = imcomplement(I); BW = imbinarize(Icomplement); imshow(BW)
Выполните скелетирование двухуровневого изображения с помощью bwskel.
out = bwskel(BW);
Отобразите скелет по оригинальному изображению при помощи labeloverlay функция. Скелет появляется как голубая линия 1 пиксель шириной по темным потокам.
imshow(labeloverlay(I,out,'Transparency',0))
Сократите маленькие шпоры, которые появляются на скелете и просматривают результат. Одна короткая ветвь сокращена от потока около центра изображения.
out2 = bwskel(BW,'MinBranchLength',15); imshow(labeloverlay(I,out2,'Transparency',0))
Считайте двухуровневое изображение в рабочую область.
BW1 = imread('circbw.tif');Скелетонайз возражает в изображении с помощью bwskel функция.
BW2 = bwskel(BW1);
Просмотрите оригинальное изображение и изображение skeletonized рядом друг с другом.
montage({BW1,BW2},'BackgroundColor','blue','BorderSize',5)
Загрузите объемный набор данных в рабочую область. Именем набора данных является spiralVol. Отобразите объем с помощью volshow.
load spiralVol.mat;
volshow(spiralVol);
Преобразуйте spiralVol набор данных к двоичному формату, который требуется bwskel функция.
spiralVolLogical = imbinarize(spiralVol);
Skeletonize спиральная форма в наборе данных. Отобразите skeletonized объем с volshow.
spiralVolSkel = bwskel(spiralVolLogical);
.
В то время как оба bwskel и bwmorph могут skeletonize 2D изображения, вы можете получить различные результаты с помощью bwmorph чем тогда, когда с помощью bwskel. Поскольку они используют различные алгоритмы, bwskel функционируйте использование, с 4 возможностями соединения с 2D изображениями; bwmorph использование, с 8 возможностями соединения.
bwskel принимает, что основные объекты в двухуровневом изображении являются белыми (логический true). Если ваше изображение имеет белый фон и черные объекты, то используйте дополнение своего изображения как вход к bwskel. Можно вычислить дополнение с помощью imcomplement.
bwskel функционируйте использует среднюю ось, преобразовывают.
[1] Та-Чих Ли, Рэнгасами Л. Кэшьяп и Чон-Нэм Чу. Создавание скелетных моделей с помощью 3-D средних алгоритмов утончения поверхности/оси. Компьютерное зрение, Графика и Обработка изображений, 56 (6):462-478, 1994.
[2] Kerschnitzki, M, Kollmannsberger, P, Burghammer, M. и др. Архитектура сети остеоцита коррелирует с качеством материала кости. Журнал Кости и Минерального Исследования, 28 (8):1837-1845, 2013.