Установите начальное состояние использоваться в определенной симуляции через SimulationInput объект, in
in = in.setInitialState( устанавливает начальное состояние модели к xInitial)xInitial, Simulink.op.ModelOperatingPoint объект.
Simulation Manager | Simulink.SimulationInput | applyToModel | loadVariablesFromMATFile | parsim | setBlockParameter | setExternalInput | setModelParameter | setPostSimFcn | setPreSimFcn | setVariable | validate