Класс: BioMap
Получите последовательность, сопоставляющую качественные баллы от BioMap объект
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj)
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj, Subset)
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj)MappingQuality, вектор из целочисленного определения, сопоставляющего качественную музыку к каждой последовательности чтения в BioObjA BioMap объект.
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj, Subset), указанным Subset.
|
Объект |
|
Одно из следующих, чтобы задать подмножество элементов в
Примечание Если вы используете массив ячеек заголовков, чтобы задать |
|
|
Создайте a BioMap объект, и затем получает качественную музыку отображения к различным элементам в объекте:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve the mapping quality property of the second element in
% the object
MQ_2 = getMappingQuality(BMObj1, 2)MQ_2 = 99
% Retrieve the mapping quality properties of the first and third % elements in the object MQ_1_3 = getMappingQuality(BMObj1, [1 3])
MQ_1_3 = 99 99
% Retrieve the mapping quality properties of all elements in the % object MQ_All = getMappingQuality(BMObj1);
Альтернатива использованию getMappingQuality метод должен использовать точечную индексацию с MappingQuality свойство:
BioObj.MappingQuality(Indices)
В предыдущем синтаксисе, Indices вектор из положительных целых чисел или логический вектор. Indices не может быть массив ячеек из символьных векторов или представить в виде строки вектор, содержащий заголовки последовательности.