Класс: BioMap
Установите последовательность, сопоставляющую качественную музыку к BioMap объект
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality)
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality, Subset)
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality)NewObj, новое BioMap объект, созданный из BioObj, существующее BioMap объект, с MappingQuality набор свойств к MappingQuality, вектор из целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения.
NewObj = setMappingQuality(BioObj, MappingQuality, Subset)NewObj, новое BioMap объект, созданный из BioObj, существующее BioMap объект, с MappingQuality свойство подмножества набора элементов к MappingQuality, вектор из целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения. Это устанавливает качественную музыку отображения только к объектным элементам, указанным Subset.
|
Объект Примечание Если |
|
Вектор из целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения. |
|
Одно из следующих, чтобы задать подмножество элементов в
Примечание Непосредственное отношение должно существовать между номером и порядком элементов в |
|
Объект |
Создайте a BioMap объект, и затем набор подмножество качественных баллов отображения:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Set the Mapping Quality property of the second element to a new
% value
BMObj1 = setMappingQuality(BMObj1, 74, 2);Обновить качественные баллы отображения в существующем BioMap объект, используйте тот же объект в качестве входа BioObj и выход NewObj.
Альтернатива использованию setMappingQuality метод, чтобы обновить существующий объект должен использовать точечную индексацию с MappingQuality свойство:
BioObj.MappingQuality(Indices) = NewMappingQuality
В предыдущем синтаксисе, Indices вектор из положительных целых чисел или логический вектор. Indices не может быть массив ячеек из символьных векторов, содержащий заголовки последовательности. NewMappingQuality вектор из целых чисел, задающих качественную музыку отображения к последовательностям чтения. Indices и NewQuality должен иметь тот же номер и порядок элементов.