DataMatrix object

Структура информации, описывающей данные и метаданные, полученные от экспериментов с микромассивом, таким образом, что она может быть проиндексирована относительно генных идентификаторов, идентификаторов проб и образцов

Описание

Объект DataMatrix является структурой данных, инкапсулирующей данные об измерении и метаданные функции из эксперимента микромассивов так, чтобы это могло быть индексировано геном или тестовыми идентификаторами и демонстрационными идентификаторами. DataMatrix экспериментальные данные объектно-ориентированной памяти в матрице, со строками, обычно соответствующими названиям генов или тестовым идентификаторам и столбцам, обычно соответствующим демонстрационным идентификаторам. Объект DataMatrix также хранит метаданные, такие как названия генов или тестовые идентификаторы и демонстрационные идентификаторы, на имена строки и имена столбцов.

Вы создаете объект DataMatrix с помощью функции конструктора Object DataMatrix.

Сводные данные свойства

Свойства объекта DataMatrix

Свойство	Описание
`Name`	Вектор символов, который описывает объект DataMatrix. Значением по умолчанию является `''`.
`RowNames`	Пустой массив или массив ячеек из символьных векторов, который задает имена для строк, обычно названий генов или тестовых идентификаторов. Число элементов в массиве ячеек должно равняться количеству строк в матрице. Значением по умолчанию является пустой массив.
`ColNames`	Пустой массив или массив ячеек из символьных векторов, который задает имена для столбцов, обычно демонстрационных идентификаторов. Число элементов в массиве ячеек должно равняться количеству столбцов в матрице.
`NRows`	Только для чтения. Положительное число, которое задает количество строк в матрице. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Можно получить доступ к нему с помощью `get` метод.
`NCols`	Только для чтения. Положительное число, которое задает количество столбцов в матрице. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Можно получить доступ к нему с помощью `get` метод.
`NDims`	Только для чтения. Положительное число, которое задает количество размерностей в матрице. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Можно получить доступ к нему с помощью `get` метод.
`ElementClass`	Только для чтения. Вектор символов, который задает тип класса элементов в объекте DataMatrix, таких как `single` или `double`. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Можно получить доступ к нему с помощью `get` метод.

Сводные данные метода

Общие методы объекта DataMatrix

Метод	Описание
`colnames`	Получите или установите имена столбцов объекта DataMatrix.
`disp`	Объект Display DataMatrix.
`display`	Отобразите объект DataMatrix, распечатав имя объекта DataMatrix. Чтобы вызвать этот метод, введите имя объекта DataMatrix в командной строке.
`dmwrite`	Запишите объект DataMatrix в текстовый файл.
`double`	Преобразуйте объект DataMatrix в массив с двойной точностью.
`get`	Получите информацию об объекте DataMatrix.
`isempty`	Определите, пуст ли объект DataMatrix.
`isfinite`	Определите, конечны ли элементы объекта DataMatrix.
`isinf`	Определите, бесконечны ли элементы объекта DataMatrix.
`isnan`	Определите, является ли элементами объекта DataMatrix NaN.
`isscalar`	Определите, является ли объект DataMatrix скаляром.
`isequal`	Протестируйте объекты DataMatrix на равенство.
`isequaln`	Протестируйте объекты DataMatrix на равенство, обработав NaNs как равный.
`isvector`	Определите, является ли объект DataMatrix вектором.
`length`	Возвратите длину объекта DataMatrix.
`ndims`	Возвратите количество размерностей в объекте DataMatrix.
`numel`	Возвратите число элементов в объекте DataMatrix.
`plot`	Чертите 2D график объекта DataMatrix.
`rownames`	Получите или определите имена строки объекта DataMatrix.
`set`	Установите свойство объекта DataMatrix.
`single`	Преобразуйте объект DataMatrix в массив с одинарной точностью.
`size`	Возвратите размер объекта DataMatrix.

Методы для управления данными в объекте DataMatrix

Метод	Описание
`cat`	Конкатенация объектов DataMatrix. `horzcat` и `vertcat` методы реализуют особые случаи.
`horzcat`	Конкатенация DataMatrix возражает горизонтально.
`sortcols`	Сортировка столбцов объекта DataMatrix в порядке возрастания или убывания.
`sortrows`	Сортировка строк объекта DataMatrix в порядке возрастания или убывания.
`subsasgn`	Преобразованное в нижний индекс присвоение для объекта DataMatrix. Чтобы вызвать этот метод, используйте круглые скобки или индексацию точки, описанную в Доступе к Данным в Объектах DataMatrix.
`subsref`	Преобразованная в нижний индекс ссылка для объекта DataMatrix. Чтобы вызвать этот метод, используйте круглые скобки или индексацию точки, описанную в Доступе к Данным в Объектах DataMatrix.
`transpose`	Объект Transpose DataMatrix.
`vertcat`	Конкатенация DataMatrix возражает вертикально.

Описательная статистика и статистическое изучение методов

Метод	Описание
`kmeans`	Кластеризация k-средних значений.
`max`	Возвратите максимальные значения в объекте DataMatrix.
`mean`	Возвратите средние или средние значения в объекте DataMatrix.
`median`	Возвратите средние значения в объекте DataMatrix.
`min`	Возвратите минимальные значения в объекте DataMatrix.
`nanmax`	Возвратите максимальные значения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nanmean`	Возвратите средние или средние значения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nanmedian`	Возвратите средние значения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nanmin`	Возвратите минимальные значения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nanstd`	Возвратите значения стандартного отклонения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nansum`	Возвратите сумму элементов в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nanvar`	Возвратите значения отклонения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`pca`	Анализ главных компонентов данных.
`pdist`	Попарное расстояние.
`std`	Возвратите значения стандартного отклонения в объекте DataMatrix.
`sum`	Возвратите сумму элементов в объекте DataMatrix.
`var`	Возвратите значения отклонения в объекте DataMatrix.

Унарные методы — экспоненциал

Метод	Описание
`exp`	Экспоненциал.
`log`	Натуральный логарифм.
`log10`	Распространенный (базируются 10), логарифм.
`log2`	Основывайте 2 логарифма и разделите числа с плавающей запятой в экспоненту и мантиссу.
`pow2`	Основывайте 2 степени и числа с плавающей запятой шкалы.
`sqrt`	Квадратный корень.

Унарные методы — целое число

Метод	Описание
`ceil`	Круглый объект DataMatrix к бесконечности.
`fix`	Круглый объект DataMatrix к нулю.
`floor`	Круглый объект DataMatrix к минус бесконечность.
`round`	Круглый объект DataMatrix до ближайшего целого числа.

Унарные методы — пользовательский

Метод	Описание
`dmarrayfun`	Примените функцию к каждому элементу в объекте DataMatrix.

Двоичные методы — арифметический оператор

Оператор	Метод	Описание
`+`	`plus`	Добавьте объекты DataMatrix
`-`	`minus`	Вычтите объекты DataMatrix.
`.*`	`times`	Умножьте объекты DataMatrix.
`./`	`rdivide`	Правый массив делит объекты DataMatrix.
`.\`	`ldivide`	Левый массив делит объекты DataMatrix.
`.^`	`power`	Степень массивов объекты DataMatrix.

Двоичные методы — оператор отношения

Оператор	Метод	Описание
`<`	`lt`	Протестируйте объекты DataMatrix на меньше, чем.
`<=`	`le`	Протестируйте объекты DataMatrix на меньше чем или равный.
`>`	`gt`	Протестируйте объекты DataMatrix на больший, чем.
`>=`	`ge`	Протестируйте объекты DataMatrix на больший, чем или равный.
`==`	`eq`	Протестируйте объекты DataMatrix на равенство.
`~=`	`ne`	Протестируйте объекты DataMatrix на неравенство.

Двоичные методы — пользовательский

Метод	Описание
`dmbsxfun`	Примените поэлементно бинарную операцию к двум объектам DataMatrix с одноэлементным включенным расширением.

Примеры

Пример 10. Определение свойств и значений свойств объекта DataMatrix

Можно отобразить все свойства и их текущие значения объекта DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

get(DMobj)

Можно возвратить все свойства и их текущие значения DMobj, объект DataMatrix, к DMstruct, скалярная структура, в которой каждое имя поля является свойством объекта DataMatrix и каждым полем, содержит значение того свойства, при помощи следующего синтаксиса:

DMstruct = get(DMobj)

Можно возвратить значение определенного свойства объекта DataMatrix, DMobj, при помощи любого из следующих синтаксисов:

PropertyValue = get(DMObj, 'PropertyName')

PropertyValue = DMObj.PropertyName

Можно возвратить значение определенных свойств объекта DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

[Property1Value, Property2Value, ...] = get(DMobj, ...
'Property1Name', 'Property2Name', ...)

Пример 11. Определение возможных значений свойств объектов DataMatrix

Можно отобразить возможные значения для всех свойств, которые имеют фиксированный набор значений свойств в объекте DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

set(DMobj)

Можно отобразить возможные значения для определенного свойства, которое имеет фиксированный набор значений свойств в объекте DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

set(DMObj,  'PropertyName')

Пример 12. Определение свойств объекта DataMatrix

Можно установить определенное свойство объекта DataMatrix, DMObj, при помощи любого из следующих синтаксисов:

DMObj = set(DMObj,  'PropertyName', PropertyValue)

DMObj.PropertyName = PropertyValue

Можно установить несколько свойств объекта DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

set(DMobj,  'PropertyName1', PropertyValue1, ...
    'PropertyName2', PropertyValue2, ...)

Примечание

Для большего количества примеров создания и использования объектов DataMatrix, смотрите Значения данных Выражения Представления в Объектах DataMatrix.

Вопросы совместимости

развернуть все

`princomp` метод был переименован

Ошибки, запускающиеся в R2017b

princomp метод DataMatrix object был переименован. Замените экземпляры princomp с pca.

Представленный в R2008b

Документация

DataMatrix object

Описание

Сводные данные свойства

Сводные данные метода

Примеры

Вопросы совместимости

`princomp` метод был переименован

Смотрите также

Документация Bioinformatics Toolbox

Поддержка

Документация

DataMatrix object

Описание

Сводные данные свойства

Сводные данные метода

Примеры

Вопросы совместимости

princomp метод был переименован

Смотрите также

Документация Bioinformatics Toolbox

Поддержка

`princomp` метод был переименован