Считайте несколько файл выравнивания последовательности
S = multialignread(File)
[Headers, Sequences]
= multialignread(File)
... = multialignread(File,
'IgnoreGaps', IgnoreGapsValue)
File | Несколько упорядочивают файл выравнивания, заданный одним из следующего:
Можно считать типы файлов выравнивания последовательности общего множителя, такие как ClustalW ( |
IgnoreGapsValue | Средства управления, удаляющие символы разрыва, такие как '-' или '.', от последовательностей. Выбором является true или false (значение по умолчанию). |
S | Массив структур MATLAB, содержащий следующие поля:
|
Headers | Массив ячеек, содержащий информацию о заголовке из файла. |
Sequences | Массив ячеек, содержащий аминокислоту или последовательности нуклеотида. |
S = multialignread(File)multialignread) и раздел последовательности. Несколько последовательностей повреждаются в блоки с тем же количеством блоков для каждой последовательности. Чтобы просмотреть пример, несколько упорядочивают файл выравнивания, вводят open aagag.aln в командной строке MATLAB.
Выход, S, массив структур где S.HeaderS.Sequence
[ читает файл в отдельные переменные, Headers, Sequences]
= multialignread(File)Headers и Sequences, которые являются массивами ячеек, содержащими информацию о заголовке и аминокислоту или последовательности нуклеотида, соответственно.
... = multialignread( управляет удалением любого символа разрыва, такого как File,
'IgnoreGaps', IgnoreGapsValue)'-' или '.', от последовательностей. Выбором является true или false (значение по умолчанию).
Считайте выравнивание последовательности кратного полибелка затычки для нескольких деформаций HIV.
gagaa = multialignread('aagag.aln')
gagaa =
1x16 struct array with fields:
Header
Sequencefastaread | gethmmalignment | multialign | multialignwrite | seqalignviewer | seqconsensus | seqdisp | seqprofile