Извлеките наклонный срез из 3-D объемных данных
извлекает 2D наклонный срез из 3-D объемных данных B
= obliqueslice(V
,point
,normal
)V
. Срез извлечен со ссылкой на данную точку на объеме и векторе нормали. Режущая плоскость перпендикулярна вектору нормали и проходит через заданную точку.
Для получения информации о том, как срез извлечен относительно данной точки и нормального, смотрите Наклонное Разрезание. Ориентация извлеченного среза в плоскости изображения зависит от своего положения в 3-D координатном пространстве. Для получения дополнительной информации смотрите Ориентацию Среза в Плоскости изображения.
задает опции с помощью одного или нескольких аргументов значения имени в дополнение к входным параметрам в предыдущем синтаксисе.B
= obliqueslice(___,Name,Value
)
Загрузите 3-D объемные данные в рабочую область.
load mri
Удалите одноэлементные размерности при помощи squeeze
функция.
V = squeeze(D);
Отобразите горизонтальные срезы данных при помощи montage
функция.
figure
montage(V,map,'Size',[3 9]);
Задайте точку в объеме для среза, чтобы пройти.
point = [73 50 15.5];
Задайте вектор нормали к плоскости в 3-D координатном пространстве.
normal = [0 15 20];
Извлеките срез из объемных данных. Срез перпендикулярен вектору нормали и проходит через заданную точку.
[B,x,y,z] = obliqueslice(V,point,normal);
Отобразите извлеченный срез в 3-D координатном пространстве.
fig = figure; axes1 = axes('Parent',fig,'Position',[0.13 0.4 0.37 0.5]); surf(x,y,z,B,'EdgeColor','None','HandleVisibility','off','Parent',axes1); grid on view([-62.6 13.8]) colormap(gray) xlabel('x-axis') ylabel('y-axis'); zlabel('z-axis'); title('Position of Slice in 3-D Coordinate Space')
Постройте точку и вектор нормали.
hold on plot3(point(1),point(2),point(3),'or','MarkerFaceColor','r'); plot3(normal(1),normal(2),normal(3),'ob','MarkerFaceColor','b'); hold off legend('Point in the volume','Normal vector','Position',[0.15 0.2 0.3 0.08])
Отобразите извлеченный срез в плоскости изображения.
axes2 = axes('Parent',fig,'Position',[0.59 0.52 0.33 0.6]); imshow(B,[],'Parent',axes2) title('Output Slice in Image Plane')
Загрузите 3-D объемные данные в рабочую область.
s = load(fullfile(toolboxdir('images'),'imdata','BrainMRILabeled','images','vol_001.mat')); V = s.vol;
Отобразите горизонтальные срезы данных при помощи montage
функция.
figure montage(V,'Indices',12:118,'Size',[8 12],'DisplayRange',[]);
Задайте вектор нормали к плоскости в 3-D координатном пространстве.
normal = [10 0 5];
Используйте for
цикл, чтобы извлечь несколько срезов вдоль направления вектора нормали. В каждой итерации задайте точку, что срез должен пройти. Установите выходной размер на 'Full'
и значение заливки для дополнения пикселей к 255.
cnt = 1; for xslice = 10:5:180 point{cnt} = [xslice 150 80]; [B(:,:,cnt),x(:,:,cnt),y(:,:,cnt),z(:,:,cnt)] = obliqueslice(V,point{cnt},normal,... 'OutputSize','Full','FillValues',255); cnt = cnt+1; end
Отобразите извлеченные срезы. Извлеченные срезы перпендикулярны вектору нормали, и проходит через заданную точку.
figure for slice = 1:size(B,3) subplot('Position',[0.11 0.36 0.38 0.5]) surf(x(:,:,slice),y(:,:,slice),z(:,:,slice),B(:,:,slice), ... 'EdgeColor','None','HandleVisibility','off'); grid on view([-24 12]) colormap(gray) xlabel('x-axis') ylabel('y-axis'); zlabel('z-axis'); zlim([0 155]); ylim([0 250]); xlim([0 250]); title('Position of Slice in 3-D Coordinate Space') % Plot the point and the normal vector. hold on plot3(point{slice}(1),point{slice}(2),point{slice}(3),'or','MarkerFaceColor','r'); plot3(normal(1),normal(2),normal(3),'ob','MarkerFaceColor','b'); legend('Point in the volume','Normal vector','Position',[0.1 0.12 0.3 0.08]) hold off % Display the extracted slice. subplot('Position',[0.6 0.37 0.34 0.49]) imshow(B(:,:,slice),[]) title('Output Slice in Image Plane') pause(0.5); end
Отобразите извлеченные фрагменты изображения при помощи montage
функция.
figure montage(B,'Size',[5 7],'DisplayRange',[]);
V
— Введите объемВведите объем в виде 3-D числового или категориального массива.
Типы данных: single
| double
| int8
| int16
| int32
| uint8
| uint16
| uint32
| logical
| categorical
point
— Укажите в объемеУкажите в объеме в виде вектора-строки с 3 элементами из формы [px py pz].
Типы данных: single
| double
| int8
| int16
| int32
| int64
| uint8
| uint16
| uint32
| uint64
normal
— Вектор нормалиВектор нормали в виде вектора-строки с 3 элементами из формы [a
b
c
].
Чтобы извлечь ортогональный срез, можно установить вектор нормали на одно из этих значений:
[1 0 0] — срез Извлечения в yz - плоскость.
[0 1 0] — срез Извлечения в xz - плоскость.
[0 0 1] — срез Извлечения в xy - плоскость.
Типы данных: single
| double
| int8
| int16
| int32
| int64
| uint8
| uint16
| uint32
| uint64
Задайте дополнительные разделенные запятой пары Name,Value
аргументы. Name
имя аргумента и Value
соответствующее значение. Name
должен появиться в кавычках. Вы можете задать несколько аргументов в виде пар имен и значений в любом порядке, например: Name1, Value1, ..., NameN, ValueN
.
obliqueslice(V,point,normal,'OutputSize','Full')
'Method'
метод интерполяции'linear'
| 'nearest'
Метод интерполяции в виде разделенной запятой пары, состоящей из 'Method'
и любое из этих значений:
'linear'
— линейная интерполяция
'nearest'
Самая близкая соседняя интерполяция
Если V
является числовым, значения по умолчанию метода интерполяции к 'linear'
но может также быть задан как 'nearest'
. Если V
является категориальным, методом интерполяции должен быть 'nearest'
.
Типы данных: char |
string
'OuputSize'
— Размер выходного изображения'limit'
(значение по умолчанию) | 'full'
Размер выходного изображения в виде разделенной запятой пары, состоящей из 'OutputSize'
и любое из этих значений:
'limit'
— Размер выходного изображения является фактическим размером 2D среза относительно размерностей входного объема. Если извлеченная область среза не является квадратной или прямоугольной, функция автоматически заполняет извлеченную область среза дополнительными пикселями, чтобы дать к квадратному или прямоугольному изображению.
'full'
— Размер выходного изображения не может быть равен фактическому размеру 2D среза. Размер выходного изображения установлен в максимальный размер среза, который может быть получен из входного объема относительно вектора нормали normal
. Чтобы изменить размер изображения, граница извлеченного 2D среза дополнена дополнительными строками и столбцами.
Значение заливки для заполненных пикселей 0 по умолчанию. Можно использовать 'FillValues
'аргумент пары "имя-значение", чтобы изменить значение.
Типы данных: char |
string
'FillValues'
— Заполните значение для заполненных пикселейmissing
Заполните значение для заполненных пикселей в виде разделенной запятой пары, состоящей из 'FillValues'
и скаляр, вектор символов или missing
.
Когда V
числовой массив, задать
0 для нулевого дополнения.
скаляр для постоянного дополнения.
Когда V
категориальный массив, задать
вектор символов, который обозначает категорию во входных данных. Чтобы знать категории, используйте categories
функция.
missing
, если категория во входных данных равна <undefined>
.
Типы данных: single
| double
| int8
| int16
| int32
| int64
| uint8
| uint16
| uint32
| uint64
| char
B
— Выведите 2D срезВыведите 2D срез, возвращенный как числовая или категориальная матрица размера m-by-n. Тип данных выходного среза - то же самое как тип данных входного объема.
Типы данных: single
| double
| int8
| int16
| int32
| uint8
| uint16
| uint32
| logical
| categorical
x
— x-координаты выходного среза в 3-D объемеx-координаты выходного среза в 3-D объеме, возвращенном как m-by-n матрица размера то же самое как выходной срез.
Типы данных: single
y
— y-координаты выходного среза в 3-D объемеy-координаты выходного среза в 3-D объеме, возвращенном как m-by-n матрица размера то же самое как выходной срез.
Типы данных: single
z
— z-координаты выходного среза в 3-D объемеz-координаты выходного среза в 3-D объеме, возвращенном как m-by-n матрица размера то же самое как выходной срез.
Типы данных: single
Учитывая точку (px, py, pz) и вектор нормали (a, b, c), функция решает плоское уравнение a (x-px) +b (y-py) +c (z-pz) = 0
Точка (px, py, pz) находится в объемных данных. Режущая плоскость перпендикулярна вектору нормали и проходит через данную точку.
Ориентация извлеченного среза в плоскости изображения зависит от своего наклонного угла относительно горизонтальных и вертикальных плоскостей.
Угол среза, который находится близкий началу координат из последнего среза, (0, 0, P), в объемных данных составляет верхний левый пиксель в плоскости изображения. Чтобы заполнить пиксельные значения в плоскости изображения, запустите с угла среза и считайте значения интенсивности в слева направо, порядок скана от начала до конца.
У вас есть модифицированная версия этого примера. Вы хотите открыть этот пример со своими редактированиями?
1. Если смысл перевода понятен, то лучше оставьте как есть и не придирайтесь к словам, синонимам и тому подобному. О вкусах не спорим.
2. Не дополняйте перевод комментариями “от себя”. В исправлении не должно появляться дополнительных смыслов и комментариев, отсутствующих в оригинале. Такие правки не получится интегрировать в алгоритме автоматического перевода.
3. Сохраняйте структуру оригинального текста - например, не разбивайте одно предложение на два.
4. Не имеет смысла однотипное исправление перевода какого-то термина во всех предложениях. Исправляйте только в одном месте. Когда Вашу правку одобрят, это исправление будет алгоритмически распространено и на другие части документации.
5. По иным вопросам, например если надо исправить заблокированное для перевода слово, обратитесь к редакторам через форму технической поддержки.