sbioplot
Постройте результаты симуляции на одном рисунке
Описание
sbioplot( графики каждая симуляция, запущенная от sd)sd, SimData объект или массив объектов, на том же рисунке. График является графиком временной зависимости каждого состояния в sd. Рисунок также показывает иерархическое отображение всех запусков как различные узлы в дереве, и можно выбрать который запуск отобразиться.
sbioplot( результаты симуляции графиков путем вызова указателя на функцию sd,fcnHandle,xArgs,yArgs,Name,Value)fcnHandle с входными параметрами sd, xArgs, и yArgs, и дополнительные опции использования заданы одним или несколькими аргументами пары "имя-значение". Например, можно задать x-метку и y-метку графика. xArgs и yArgs должны быть массивы ячеек или векторы строки из имен состояний, чтобы построить.
Примеры
Постройте выбранные состояния от данных моделирования
Постройте добычу по сравнению с данными о хищнике из стохастическим образом симулированной lotka модели при помощи пользовательской функции (plotXY).
Загрузите модель. Установите тип решателя на SSA выполнять стохастические симуляции и устанавливать время остановки на 3.
sbioloadproject lotka; cs = getconfigset(m1); cs.SolverType = 'SSA'; cs.StopTime = 3; rng('default') % For reproducibility
Определите номер запусков и используйте sbioensemblerun для симуляции.
numRuns = 2; sd = sbioensemblerun(m1,numRuns);
Постройте данные моделирования. По умолчанию, sbioplot показывает график временной зависимости каждой разновидности для каждого запуска.
sbioplot(sd);
Постройте выбранные состояния друг против друга; в этом случае постройте популяцию жертв по сравнению с популяцией хищников. Используйте функциональный plotXY (показанный в конце этого примера), чтобы построить симулированный y1 (добыча) данные по сравнению с y2 (хищник) данные. Задайте функцию как указатель на функцию.
Если вы используете файл live скрипта для этого примера, plotXY функция уже включена в конце файла. В противном случае необходимо задать plotXY функционируйте в конце своего.m или .mlx файла или добавьте его как файл на пути MATLAB.
sbioplot(sd,@plotXY,{'y1'},{'y2'},'xlabel','y1','ylabel','y2','title','Prey versus Predator');
Задайте Функцию plotXY
sbioplot принимает указатель на функцию для функции с подписью:
function [handles,names] = functionName(sd,xArgs,yArgs).
plotXY графики функций два выбранных состояния друг против друга. Первый вход sd данные моделирования (SimBiology SimData объект или вектор из объектов). В этом конкретном примере xArgs является массивом ячеек, содержащим имя разновидностей, которые будут построены на оси X, и yArgs является массивом ячеек, содержащим имя вторых разновидностей, которые будут построены на оси Y. Однако можно использовать входные параметры xArgs и yArgs в любом случае в пользовательской функции построения графика. Функция возвращает handles, массив указателей на функцию к линейным графикам и names, массив ячеек из символьных векторов, показанный на узлах, которые являются дочерними элементами узла Запуска в иерархическом отображении.
function [handles,names] = plotXY(sd,xArgs,yArgs) % Select simulation data for each state from each run. xData1 = selectbyname(sd(1),xArgs); xData2 = selectbyname(sd(2),xArgs); yData1 = selectbyname(sd(1),yArgs); yData2 = selectbyname(sd(2),yArgs); % Plot the species against each other. fH1 = plot(xData1.Data,yData1.Data); fH2 = plot(xData2.Data,yData2.Data); % The first output, handles, is a two-dimensional array of handles of the line plots. It must be of size M x N, % where M is the number of line plots for each run and N is the number of runs. handles = [fH1,fH2]; % The second output, names, must be a one-dimensional cell array of character vectors. % Its length must be equal to the number of rows in handles, and the texts are displayed on the % nodes that are children of a Run node. names = {'y1 vs y2'}; end