select

Выберите данные моделирования из SimData объект с помощью выражений

свернуть все на странице

Синтаксис

[t,x,names] = select(simdata,query)
sdOut = select(simdata,query)
___ = select(simdata,query,'Format',formatValue)

Описание

пример

[t,x,names] = select(simdata,query) возвращается время симуляции указывает t, данные моделирования x, и соответствующий names для столбцов данных то соответствие query.

пример

sdOut = select(simdata,query) возвращает результаты симуляции, которые совпадают с query как SimData объект sdOut.

пример

___ = select(simdata,query,'Format',formatValue) возвращает запрошенные данные моделирования в заданном формате данных.

Примеры

свернуть все

Скрипт Open Live Script

Загрузите модель ответа инсулина глюкозы. Для получения дополнительной информации о модели, смотрите раздел Background в Симуляции Ответа Инсулина Глюкозы.

sbioloadproject('insulindemo.sbproj','m1');

Подавите информацию, предупреждающую, который выпущен во время симуляций.

warnSettings = warning('off', 'SimBiology:DimAnalysisNotDone_MatlabFcn_Dimensionless');

Симулируйте одну еду для нормального предмета в течение 7 часов.

singleMeal = sbioselect(m1,'Name','Single Meal');
cs = getconfigset(m1,'active');
cs.StopTime = 7;
sd = sbiosimulate(m1,singleMeal)
 
   SimBiology Simulation Data
 
   ModelName:        Cobelli's Glucose-Insulin System
   Logged Data:
     Species:        15
     Compartment:    0
     Parameter:      24
     Sensitivity:    0
     Observable:     0
 

sbioplot(sd);

Выберите все данные о разновидностях, вошел в систему SimData объект sd.

[t,x,names] = select(sd,{'Type','species'});
names
names = 15x1 cell
    {'Glucose appearance.Dose'              }
    {'Glucose appearance.Stomach Glu Solid' }
    {'Glucose appearance.Stomach Glu Tritur'}
    {'Glucose appearance.Stomach Glu'       }
    {'Glucose appearance.Gut Glu'           }
    {'Glucose appearance.Plasma Glu'        }
    {'Glucose appearance.Plasma Glu Conc'   }
    {'Glucose appearance.Tissue Glu'        }
    {'Insulin secretion.Interstitial Ins'   }
    {'Insulin secretion.Portal Ins'         }
    {'Insulin secretion.Liver Ins'          }
    {'Insulin secretion.Plasma Ins'         }
    {'Insulin secretion.Plasma Ins Conc'    }
    {'Insulin secretion.Ins Delay 1'        }
    {'Insulin secretion.Ins Delay 2'        }

Отобразите данные на графике для уровня глюкозы внешнего вида и использования глюкозы, а именно, Glu Появляются Rate и Glu Util.

newsd = select(sd,{'Type','parameter','name',{'Glu Appear Rate'; 'Glu Util'}})
 
   SimBiology Simulation Data
 
   ModelName:        Cobelli's Glucose-Insulin System
   Logged Data:
     Species:        0
     Compartment:    0
     Parameter:      2
     Sensitivity:    0
     Observable:     0
 

sbioplot(newsd);

Сравните данные для плазменной концентрации глюкозы (разновидности под названием Plasma Glu Conc) и уровень секреции инсулина (параметр под названием Ins Secr). Используйте selectbyname извлекать данные путем определения соответствующих имен.

newsd2 = selectbyname(sd,{'Plasma Glu Conc','Ins Secr'})
 
   SimBiology Simulation Data
 
   ModelName:        Cobelli's Glucose-Insulin System
   Logged Data:
     Species:        1
     Compartment:    0
     Parameter:      1
     Sensitivity:    0
     Observable:     0
 

sbioplot(newsd2);

Выберите данные для всех разновидностей и параметров, которые имеют Glu на их имена.

newsd3 = select(sd,{'Where','Name','regexp','Glu'})
 
   SimBiology Simulation Data
 
   ModelName:        Cobelli's Glucose-Insulin System
   Logged Data:
     Species:        7
     Compartment:    0
     Parameter:      11
     Sensitivity:    0
     Observable:     0
 

newsd3.DataNames
ans = 18x1 cell
    {'Stomach Glu Solid'       }
    {'Stomach Glu Tritur'      }
    {'Stomach Glu'             }
    {'Gut Glu'                 }
    {'Plasma Glu'              }
    {'Plasma Glu Conc'         }
    {'Tissue Glu'              }
    {'Stomach Glu After Dosing'}
    {'Glu Appear Rate'         }
    {'Glu Prod'                }
    {'Plasma Glu Conc Rate'    }
    {'Ins Dep Glu Util'        }
    {'Glu Util'                }
    {'Glu Excretion'           }
    {'Glu Excretion Mode'      }
    {'Delayed Glu Signal'      }
    {'Delayed Glu Signal Mode' }
    {'Basal Glu Prod'          }

Можно также возвратить выбранные данные как структуру.

sdStruct = select(sd,{'Where','Name','regexp','Glu'},'Format','struct');

Восстановите настройки предупреждения.

warning(warnSettings);

Входные параметры

свернуть все

Данные моделирования в виде SimData объект или массив SimData объекты.

Поисковый запрос в виде массива ячеек из символьных векторов или вектора строки. Запрос состоит из некоторой комбинации аргументов пары "имя-значение" или 'Where' пункты. Для большего количества полного описания синтаксиса запроса, включая 'Where' пункты и их поддерживаемые типы условия, смотрите sbioselect. Однако единственный булев оператор, что функциональными поддержками является and.

Можно использовать любое из полей метаданных, доступных в DataInfo свойство SimData объект в запросе. Поля включают 'Type'ИмяМодули, 'Compartment' (только для разновидностей), и 'Reaction' (только для параметров).

Пример: {'Type','species'}

Типы данных: string | cell

Формат данных моделирования в виде вектора символов или строки. Некоторые форматы требуют, чтобы вы задали только один выходной аргумент. Допустимые форматы следуют.

  • 'num' — Этот формат возвращает точки времени симуляции и данные моделирования в числовых массивах и именах количеств и чувствительности как массив ячеек. Этот формат является значением по умолчанию, когда вы запускаете getdata с несколькими выходными аргументами.

  • 'nummetadata' — Этот формат возвращает массив ячеек структур метаданных вместо имен количеств и чувствительности как третий выходной аргумент.

  • 'numqualnames' — Этот формат возвращает полностью определенные имена в третьем выходном аргументе, чтобы разрешить неоднозначности.

Необходимо задать только один выходной аргумент в пользу следующих форматов.

  • 'simdata' — Этот формат возвращает данные в новом SimData возразите или массив SimData объекты. Этот формат является значением по умолчанию, когда вы задаете один выходной аргумент.

  • 'struct' — Этот формат возвращает структуру или массив структур, который содержит и данные и метаданные.

  • 'ts' — Этот формат возвращает данные как массив ячеек.

    • Если simdata скаляр, массивом ячеек является m-by-1 массив, где каждым элементом является timeseries объект. m является количеством количеств и чувствительности, регистрируемой во время симуляции.

    • Если simdata не скаляр, массивом ячеек является k-by-1, где каждым элементом массива ячеек является m-by-1 массив ячеек timeseries объекты. k является размером simdata, и m является количеством количеств или чувствительности в каждом SimData объект в simdata. Другими словами, функция возвращает отдельные временные ряды для каждого состояния или столбца и для каждого SimData объект в simdata.

  • 'tslumped' — Этот формат возвращает данные как массив ячеек timeseries объекты, комбинируя данные из каждого SimData объект в одни временные ряды.

Выходные аргументы

свернуть все

Точки времени симуляции, возвращенные как числовой векторный массив или массив ячеек. Если simdata скаляр, t n-by-1 вектор, где n является количеством моментов времени. Если simdata массив объектов, t k-by-1 массив ячеек, где k является размером simdata.

Данные моделирования, возвращенные как числовой матричный или массив ячеек. Если simdata скаляр, x n-by-m матрица, где n является количеством моментов времени, и m является количеством количеств и чувствительности, регистрируемой во время симуляции. Если simdata массив объектов, x k-by-1 массив ячеек, где k является размером simdata.

Имена количеств и чувствительности, регистрируемой во время симуляции, возвращенной как массив ячеек. Если simdata скаляр, names m-by-1 массив ячеек. Если simdata массив объектов, names k-by-1 массив ячеек, где k является размером simdata.

Результаты симуляции, возвращенные как SimData объект.

Смотрите также

| |

Представленный в R2007b

Документация SimBiology

Поддержка

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте