fixedEffects

Класс: LinearMixedModel

Оценки фиксированных эффектов и связанной статистики

Описание

beta = fixedEffects(lme) возвращает предполагаемые коэффициенты фиксированных эффектов, beta, из линейной модели lme смешанных эффектов.

пример

[beta,betanames] = fixedEffects(lme) также возвращает имена предполагаемых коэффициентов фиксированных эффектов в betanames. Каждое имя соответствует коэффициенту фиксированных эффектов в beta.

пример

[beta,betanames,stats] = fixedEffects(lme) также возвращает предполагаемые коэффициенты фиксированных эффектов линейной модели lme смешанных эффектов и связанная статистика в stats.

пример

[beta,betanames,stats] = fixedEffects(lme,Name,Value) также возвращает предполагаемые коэффициенты фиксированных эффектов линейной модели lme смешанных эффектов и связанная статистика с дополнительными опциями, заданными одним или несколькими Name,Value парные аргументы.

Входные параметры

развернуть все

Линейная модель смешанных эффектов в виде LinearMixedModel объект создал использование fitlme или fitlmematrix.

Аргументы в виде пар имя-значение

Задайте дополнительные разделенные запятой пары Name,Value аргументы. Name имя аргумента и Value соответствующее значение. Name должен появиться в кавычках. Вы можете задать несколько аргументов в виде пар имен и значений в любом порядке, например: Name1, Value1, ..., NameN, ValueN.

Уровень значения в виде разделенной запятой пары, состоящей из 'Alpha' и скалярное значение в области значений от 0 до 1. Для значения α, доверительный уровень равняется 100* (1–α) %.

Например, для 99% доверительных интервалов, можно задать доверительный уровень можно следующим образом.

Пример: 'Alpha',0.01

Типы данных: single | double

Метод для вычисления аппроксимированных степеней свободы для t - статистическая величина, которая тестирует коэффициенты фиксированных эффектов против 0 в виде разделенной запятой пары, состоящей из 'DFMethod' и одно из следующих.

'residual'Значение по умолчанию. Степени свободы приняты постоянным и равняются np, где n является количеством наблюдений, и p является количеством фиксированных эффектов.
'satterthwaite'Приближение Satterthwaite.
'none'Все степени свободы установлены в бесконечность.

Например, можно задать приближение Satterthwaite можно следующим образом.

Пример: 'DFMethod','satterthwaite'

Выходные аргументы

развернуть все

Содействующие оценки фиксированных эффектов подходящей линейной модели lme смешанных эффектов, возвращенный как вектор.

Имена коэффициентов фиксированных эффектов в beta, возвращенный как таблица.

Фиксированные эффекты оценивают и связанная статистика, возвращенная как массив набора данных, который ссорится для каждого из фиксированных эффектов и одного столбца для каждых из следующих статистических данных.

NameИмя фиксированного коэффициента эффекта
EstimateПредполагаемое содействующее значение
SEСтандартная погрешность оценки
tStatt- для теста, что коэффициент является нулем
DFПредполагаемые степени свободы для t - статистическая величина
pValuep- для the t-статистической-величины
LowerНижний предел 95%-го доверительного интервала для коэффициента фиксированного эффекта
UpperВерхний предел 95%-го доверительного интервала для коэффициента фиксированного эффекта

Примеры

развернуть все

Загрузите выборочные данные.

load('weight.mat');

Набор данных weight содержит данные из продольного исследования, где 20 предметов случайным образом присвоены 4 программам подготовки, и их потеря веса зарегистрирована более чем шесть 2-недельных периодов времени. Это - симулированные данные.

Храните данные в таблице. Задайте Subject и Program как категориальные переменные.

tbl = table(InitialWeight,Program,Subject,Week,y);
tbl.Subject = nominal(tbl.Subject);
tbl.Program = nominal(tbl.Program);

Подбирайте линейную модель смешанных эффектов, где начальный вес, тип программы, неделя и взаимодействие между неделей и программой являются фиксированными эффектами. Прерывание и неделя варьируется предметом.

lme = fitlme(tbl,'y ~ InitialWeight + Program*Week + (Week|Subject)');

Отобразите содействующие оценки фиксированных эффектов и соответствующие имена фиксированных эффектов.

[beta,betanames] = fixedEffects(lme)
beta = 9×1

    0.6610
    0.0032
    0.3608
   -0.0333
    0.1132
    0.1732
    0.0388
    0.0305
    0.0331

betanames=9×1 table
           Name       
    __________________

    {'(Intercept)'   }
    {'InitialWeight' }
    {'Program_B'     }
    {'Program_C'     }
    {'Program_D'     }
    {'Week'          }
    {'Program_B:Week'}
    {'Program_C:Week'}
    {'Program_D:Week'}

Загрузите выборочные данные.

load carbig

Подбирайте линейную модель смешанных эффектов для миль на галлон (MPG) с фиксированными эффектами для ускорения и лошадиной силы, и потенциально коррелировал случайные эффекты для прерывания и ускорения, сгруппированного модельным годом. Во-первых, храните данные в таблице.

tbl = table(Acceleration,Horsepower,Model_Year,MPG);

Подбирайте модель.

lme = fitlme(tbl, 'MPG ~ Acceleration + Horsepower + (Acceleration|Model_Year)');

Вычислите содействующие оценки фиксированных эффектов и связанную статистику.

[~,~,stats] = fixedEffects(lme)
stats = 
    Fixed effect coefficients: DFMethod = 'Residual', Alpha = 0.05

    Name                    Estimate    SE           tStat      DF 
    {'(Intercept)' }          50.133       2.2652     22.132    389
    {'Acceleration'}        -0.58327      0.13394    -4.3545    389
    {'Horsepower'  }        -0.16954    0.0072609     -23.35    389


    pValue        Lower       Upper   
    7.7727e-71      45.679      54.586
    1.7075e-05    -0.84661    -0.31992
     5.188e-76    -0.18382    -0.15527

Маленькое p- значения (под pValue) укажите, что все коэффициенты фиксированных эффектов являются значительными.

Загрузите выборочные данные.

load('shift.mat');

Данные показывают отклонения от целевой качественной характеристики, измеренной от продуктов, что пять операторов производят во время трех сдвигов: утро, вечер и ночь. Это - рандомизированная блочная конструкция, где операторы являются блоками. Эксперимент спроектирован, чтобы изучить удар времени сдвига на эффективности. Критерием качества работы является отклонение качественных характеристик от целевого значения. Это - симулированные данные.

Shift и Operator номинальные переменные.

shift.Shift = nominal(shift.Shift);
shift.Operator = nominal(shift.Operator);

Подбирайте линейную модель смешанных эффектов со случайным прерыванием, сгруппированным оператором, чтобы оценить, если эффективность значительно отличается согласно времени сдвига.

lme = fitlme(shift,'QCDev ~ Shift + (1|Operator)');

Вычислите 99% доверительных интервалов для коэффициентов фиксированных эффектов, с помощью остаточного метода, чтобы вычислить степени свободы. Это - метод по умолчанию.

[~,~,stats] = fixedEffects(lme,'alpha',0.01)
stats = 
    Fixed effect coefficients: DFMethod = 'Residual', Alpha = 0.01

    Name                     Estimate    SE         tStat       DF    pValue   
    {'(Intercept)'  }         3.1196     0.88681      3.5178    12    0.0042407
    {'Shift_Morning'}        -0.3868     0.48344    -0.80009    12      0.43921
    {'Shift_Night'  }         1.9856     0.48344      4.1072    12    0.0014535


    Lower      Upper 
    0.41081    5.8284
    -1.8635    1.0899
     0.5089    3.4623

Вычислите 99% доверительных интервалов для коэффициентов фиксированных эффектов, с помощью приближения Satterthwaite, чтобы вычислить степени свободы.

[~,~,stats] = fixedEffects(lme,'DFMethod','satterthwaite','alpha',0.01)
stats = 
    Fixed effect coefficients: DFMethod = 'Satterthwaite', Alpha = 0.01

    Name                     Estimate    SE         tStat       DF       pValue 
    {'(Intercept)'  }         3.1196     0.88681      3.5178    6.123    0.01214
    {'Shift_Morning'}        -0.3868     0.48344    -0.80009       10    0.44225
    {'Shift_Night'  }         1.9856     0.48344      4.1072       10    0.00212


    Lower       Upper 
    -0.14122    6.3804
      -1.919    1.1454
     0.45343    3.5178

Приближение Satterthwaite обычно производит меньший DF значения, чем остаточный метод. Именно поэтому это производит больше p- значения (pValue) и большие доверительные интервалы (см. Lower и Upper).

Смотрите также

| | | |

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте