Оптимальное листовое упорядоченное расположение для иерархической кластеризации
возвращает оптимальное листовое упорядоченное расположение для иерархического бинарного кластерного дерева, leafOrder
= optimalleaforder(tree
,D
)tree
, с помощью расстояний, D
. Оптимальное листовое упорядоченное расположение двоичного дерева максимизирует сумму общих черт между смежными листами путем зеркального отражения древовидных ветвей, не деля кластеры.
возвращает оптимальное листовое упорядоченное расположение с помощью одного или нескольких аргументов пары "имя-значение".leafOrder
= optimalleaforder(tree
,D
,Name,Value
)
[1] Панель-Joseph, Z., Гиффорд, D.K., и Jaakkola, T.S. (2001). "Быстро оптимальное листовое упорядоченное расположение для иерархической кластеризации". Издание 17 биоинформатики, Suppl 1:S22–9. PMID: 11472989.
dendrogram
| linkage
| pdist