Исследуйте 3-D маркированные объемные данные с помощью приложения Volume Viewer

В этом примере показано, как исследовать 3-D маркированные объемные данные с помощью приложения Volume Viewer. Используя приложение, можно просмотреть маркированный объем самостоятельно или просмотреть метки как наложение на объем интенсивности. Чтобы проиллюстрировать, пример загружает объем интенсивности, который показывает мозг человека с маркированными областями, которые показывают местоположение и тип опухолей, обнаруженных в мозге.

Загрузка маркированного объема и объема интенсивности в Volume Viewer

В этой части примера показано, как загрузить маркированный объем и объем интенсивности в Volume Viewer.

Загрузите данные интенсивности МРТ человеческого мозга и маркированный объем из MAT-файлов в рабочую область. Эта операция создает две переменные в рабочей области: vol и label.

load(fullfile(toolboxdir('images'),'imdata','BrainMRILabeled','images','vol_001.mat'));
load(fullfile(toolboxdir('images'),'imdata','BrainMRILabeled','labels','label_001.mat'));

whos
Name         Size                    Bytes  Class     Attributes

  label      240x240x155             8928000  uint8               
  vol        240x240x155            17856000  uint16              

Откройте Volume Viewer приложение Из MATLAB® откройте вкладку Приложения и в разделе Обработка изображений и Компьютерном зрении щелкните. Вы также можете открыть приложение, используя volumeViewer команда.

Загрузите маркированный том в приложение «Volume Viewer». Нажмите кнопку Import Labeled Volume, чтобы открыть маркированный том. Можно загрузить изображение в имя файла или переменную из рабочей области. (Если у вас есть объемные данные в формате DICOM, который использует несколько файлов для представления тома, можно задать имя папки DICOM.) В данном примере выберите опцию Import From Workspace.

Выберите переменную рабочей области, связанную с маркированными объемными данными, в диалоговом окне Import from Workspace и нажмите OK.

Просмотр маркированного объема в Volume Viewer

В этой части примера данные маркированного объема отображаются в Volume Viewer.

Просмотр маркированного объема в приложении «Volume Viewer». По умолчанию в Volume Viewer» данные отображаются как маркированный том, но можно также просмотреть как плоскости разбиения. Чтобы исследовать маркированный объем, увеличьте и уменьшите изображение с помощью колеса мыши или щелчка правой кнопкой мыши. Можно также повернуть громкость, установив курсор в окне изображения, нажав и удерживая мышь, и перемещая курсор. Вы всегда изменяете масштаб или вращаетесь вокруг центра объема. Положение осей в Orientation Axes окне отражает пространственную ориентацию маркированного объема при его повороте.

Уточните вид маркированного объема с помощью Rendering Editor части Volume Viewer. Можно использовать Rendering Editor, чтобы просмотреть определенные метки и скрыть другие, изменить цвет и изменить прозрачность меток. Метка 000 является фоном, и она обычно не отображается. При выборе метки фона флажок Show Labels по умолчанию снимается. Чтобы выбрать все видимые метки сразу, выберите метку фона и нажатия кнопки Invert Selection. Чтобы изменить цвет метки (или всех меток), выберите метку в Rendering Editor и укажите цвет в селекторе Color. Управлять прозрачностью метки можно также с помощью Opacity ползунка.

Встраивание маркированного объема с объемом интенсивности

В этой части примера вы одновременно просматриваете маркированный объем и объем интенсивности в Volume Viewer. Просмотр маркированного объема, наложенного на объем интенсивности, может предоставить контекст для данных.

С помеченным объемом, уже находящимся в Volume Viewer, загрузите объем интенсивности в приложение. Нажмите Import Volume и выберите опцию Import From Workspace.

Выберите переменную рабочей области, связанную с объемом интенсивности, в диалоговом окне Import from Workspace и нажмите OK.

В Volume Viewer» отображается маркированный объем по объемным данным интенсивности. По умолчанию в Volume Viewer отображаются данные меток и данные интенсивности как объемы, но можно также просмотреть их как плоскости разбиения. Чтобы исследовать маркированные и интенсивные объемы, увеличьте и уменьшите изображение с помощью колеса мыши или щелчка правой кнопкой мыши. Можно также повернуть объемы, установив курсор в окне изображения, нажав и удерживая мышь, и перемещая курсор. Чтобы просмотреть только объем интенсивности и скрыть маркированный объем, нажмите кнопку View Volume.

Уточнить представление маркированного объема и объема интенсивности можно используя опции в Rendering Editor. Чтобы просмотреть только маркированный объем и скрыть объем интенсивности, снимите флажок Embed Labels in Volume. В Labels области Rendering Editor можно выбрать любую из меток и изменить ее цвет или прозрачность. Метка 000 является фоном. По умолчанию фон имеет черный цвет и не отображается. Флажок Show Labels снят. Чтобы выбрать все метки, щелкните на фоне и затем щелкните Invert Selection. Если объем интенсивности видим, можно изменить пороговое значение и прозрачность с помощью ползунков в Volume области Rendering Editor.