edfwrite
Создайте или измените файл EDF или EDF +
Описание
Создайте edfwrite объект для записи или изменения файла European Data Format (EDF) или EDF +.
Создание
Синтаксис
Описание
edfw = edfwrite(filename)edfwrite объект для существующего файла EDF или EDF +, заданный как filename.
edfw = edfwrite(filename,hdr,annotationslist)edfwrite объект и новый файл EDF или EDF + с аннотациями, annotationslist.
edfw = edfwrite(filename,hdr,sigdata,annotationslist)edfwrite объект и новый файл EDF или EDF + с сигнальными данными и аннотациями.
edfw = edfwrite(___,Name,Value)DataRecordTimes, AnnotationsEncoding, и InputSampleType.
Входные параметры
Свойства
Функции объекта
addAnnotations | Добавьте аннотации к файлу EDF или EDF + |
addSignals | Добавьте новые сигналы в файл EDF или EDF + |
deleteAnnotations | Удалите аннотации из файла EDF или EDF + |
deleteSignals | Удалите сигналы из EDF или файла EDF + |
modifyAnnotations | Изменение аннотаций в EDF или EDF + файле |
modifyHeader | Измените подробности заголовка файла EDF или EDF + |
modifySignals | Изменяйте сигналы в EDF или EDF + файле |
Примеры
Создание файла EDF + с аннотациями
Загрузка EMGdata.mat в рабочую область. Файл содержит восемь каналов данных поверхностной электромиографии (ЭМГ) [1], зарегистрированных из восьми мышц руки. Данные доступны в www.sce.carleton.ca/faculty/chan/index.php?page=matlab. Частота дискретизации составляет 1000 Гц. Постройте график сигналов.
load EMGdata
fs = 1000;
t = 0:1/fs:(size(data,1)-1)/fs;
stackedplot(t,data)
Всплески увеличенной амплитуды сигнала соответствуют различным движениям предплечья, которые длятся 3 секунды каждый. EMGindex.mat содержит тип движения и начальный индекс (выборку) каждого движения в двух переменных: motion и start_index. Типы движения:
Рука открытая
Закрытие рук
Сгибание запястья
Расширение запястья
Супинация
Пространа
Отдых
Загрузите данные в рабочую область.
load EMGindexСоставьте расписание аннотаций.
Использование
Onsetдля определения времени строки.Onsetсодержит начальный индекс каждого движения в секундах.Annotationsзадает типы движения как строковые массивы.Durationзадает длительность каждого движения в секундах.
Onset = seconds(start_index./fs); Annotations = string(motion); Duration = seconds(ones(length(Onset),1)*3); annotationslist = timetable(Onset,Annotations,Duration);
Использование edfheader чтобы создать структуру заголовка для файла EDF + и задать свойства. См. edfheader для получения дополнительной информации.
hdr = edfheader("EDF+"); hdr.NumDataRecords = 1; hdr.DataRecordDuration = seconds(length(data(:,1))/fs); hdr.NumSignals = 8; hdr.SignalLabels = ["F1" "F2" "F3" "F4" "F5" "F6" "F7" "B1"]; hdr.PhysicalDimensions = repelem("mV",8); hdr.PhysicalMin = min(data); hdr.PhysicalMax = max(data); hdr.DigitalMin = [-32768 -32768 -32768 -32768 -32768 -32768 -32768 -32768]; hdr.DigitalMax = [32767 32767 32767 32767 32767 32767 32767 32767];
Запишите файл EDF +, содержащий структуру заголовка, данные о сигнале и аннотации. Задайте тип входа выборки следующим physical. Файл сохранен в текущей рабочей директории.
edfw = edfwrite("armEMG.edf",hdr,data,annotationslist,'InputSampleType',"physical");
Отображение информации о файле.
edfinfo("armEMG.edf")ans =
edfinfo with properties:
Filename: "armEMG.edf"
FileModDate: "21-Apr-2021 04:48:14"
FileSize: 4803836
Version: "0"
Patient: "1234567 F 21-Apr-2021 Patient_1"
Recording: "Startdate 21-Apr-2021 MW_1234567 MW_Inv_01 MW_Eq_01"
StartDate: "21.04.21"
StartTime: "04.48.13"
HeaderBytes: 2560
Reserved: "EDF+C"
NumDataRecords: 1
DataRecordDuration: 300.03 sec
NumSignals: 8
SignalLabels: [8x1 string]
TransducerTypes: [8x1 string]
PhysicalDimensions: [8x1 string]
PhysicalMin: [8x1 double]
PhysicalMax: [8x1 double]
DigitalMin: [8x1 double]
DigitalMax: [8x1 double]
Prefilter: [8x1 string]
NumSamples: [8x1 double]
SignalReserved: [8x1 string]
Annotations: [28x2 timetable]
Можно использовать EDF File Analyzer, чтобы просмотреть сигналы и аннотации, хранящиеся в файле. Используйте Signal Separation опция разделения сигналов для лучшей визуализации.
Удалите файл EDF +. Закомментируйте этот код, если хотите сохранить файл.
delete armEMG.edfСовет
Чтобы создать файл EDF +, содержащий только аннотации, задайте
NumDataRecordsиNumSignalsкак0,DataRecordDurationкак скаляр длительности со значением0, и все свойства сигнала как пустые.Запустите приложение EDF File Analyzer, чтобы визуализировать сигналы в файле EDF или EDF +.
Ссылки
[1] Chan, Adrian D.C., and Geoffrey C. Green. 2007. Myoelectric Control Development Toolbox (неопр.) (недоступная ссылка). Документ, представленный на 30-й конференции Канадского общества медицинской и биологической инженерии, Торонто, Канада, 2007 год.
[2] Кемп, Боб, Альпо Вярри, Агостиньо С. Роза, Ким Д. Нильсен и Джон Гейд. «Простой формат обмена оцифрованными полиграфическими записями». Электроэнцефалография и клиническая нейрофизиология 82, № 5 (май 1992): 391-93. https://doi.org/10.1016/0013-4694 (92) 90009-7.
[3] Кемп, Боб и Иисус Оливан. European Data Format 'plus' (EDF +), стандартный формат EDF для обмена физиологическими данными. Клиническая нейрофизиология 114, № 9 (2003): 1755-1761. https://doi.org/10.1016/S1388-2457 (03) 00123-8.