Создайте простую модель

В этом примере показано, как создать простую модель с двумя видами (A и B) и реакцией. Реакция следующая A -> B, который следует кинетике действующих масс с параметром прямой скорости k. Следовательно, скорость изменения $dA/dt=-k*A$.

Создайте модель SimBiology с именем simpleModel.

m1 = sbiomodel('simpleModel');

Добавьте реакцию, которая включает два вида A и B, где A преобразуется в B.

r1 = addreaction(m1,'A -> B');

SimBiology автоматически добавляет виды A и B в модель.

m1.species

ans = 
   SimBiology Species Array

   Index:    Compartment:    Name:    Value:    Units:
   1         unnamed         A        0               
   2         unnamed         B        0               

Установите начальное количество первого вида (A) к 10.

m1.species(1).InitialAmount = 10;

Определите кинетический закон реакции, чтобы следовать кинетике действующих масс. Вы можете добиться этого, добавив объект кинетического закона к реакции r1.

kineticLaw = addkineticlaw(r1,'MassAction');

Добавьте параметр константы скорости в кинетический закон действия масс. Вы должны задать ParameterVariableNames свойство объекта кинетического закона соответствует имени параметра 'k' так, чтобы можно было определить скорость реакции.

p1 = addparameter(kineticLaw,'k',0.5);
kineticLaw.ParameterVariableNames = 'k';

Симулируйте модель.

sd = sbiosimulate(m1);

Постройте график результатов симуляции.

sbioplot(sd);