simbiology | Откройте SimBiology Model Builder |
sbiomodel | Создайте объект модели |
sbioroot | Возврат корневого объекта SimBiology |
sbioreset | Удалите все объекты модели |
sbioselect | Поиск объектов с заданными ограничениями |
sbiolastwarning | Последнее предупреждение SimBiology |
sbiolasterror | Последнее сообщение об ошибке SimBiology |
verify | Проверьте и проверьте модель SimBiology |
addcompartment | Создайте объект отсека |
addobservable | Добавьте наблюдаемый объект к модели SimBiology |
addspecies | Создайте видовой объект и добавьте к отсечному объекту в объект модели |
addparameter | Создайте объект параметра и добавьте к объекту модели или кинетического закона |
addreaction | Создайте объект реакции и добавьте к объекту модели |
addrule | Создайте объект правила и добавьте к объекту модели |
addevent | Добавьте объект события к объекту модели |
findUnusedComponents | Найдите неиспользованные виды, параметры и отсеки в модели |
findUsages(species,parameter,compartment) | Узнайте, как вид, параметр или отсек используется в модели |
findUsages | Узнайте, как наблюдаемый объект используется в модели SimBiology |
findUsages(unit,unitprefix) | Узнайте, как используется префикс модуля измерения или модуля |
findUsages(AbstractKineticLaw) | Узнайте, как используется объект AbstractKineticLaw |
updateInitialAssignments | Обновите начальные правила назначения, чтобы удалить зависимости порядка |
Model | Информация о модели и компоненте |
Observable | Объект, содержащий выражение для вычислений после постсимуляции |
Compartment | Объект, содержащий информацию о отсеке |
Species | Объект, содержащий информацию о видах |
Parameter | Информация о параметре и возможностях |
Reaction | Объект, содержащий информацию о реакции модели |
KineticLaw | Информация о кинетическом законе для реакции |
Rule | Hold rule для видов и параметров |
Event | Сохраните информацию о событии |
Root | Удерживайте модели, единичные библиотеки и абстрактные библиотеки кинетического права |
PKModelDesign object | Вспомогательный объект для создания фармакокинетической модели |
PKCompartment object | Используется в PKModelDesign для создания модели SimBiology |
PKModelMap object | Определите роли компонентов модели SimBiology |
construct | Создайте модель SimBiology из PKModelDesign объект |
addCompartment | Добавить отсек в PKModelDesign объект |
| SimBiology Model Builder | Создание моделей биологии QSP, PK/PD и механистических систем в интерактивном режиме |
| SimBiology Model Analyzer | Анализ моделей биологии QSP, PK/PD и механистических систем |
Создайте модель кинетики рецептора-лиганда
Этот пример показывает, как создать и симулировать простую модель кинетики рецептор-лиганд с помощью SimBiology Model Builder и SimBiology Model Analyzer приложений.
Включить ингибирование рецептора 2 (SGLT2) глюкозы натрия гипотетическим соединением в существующую модель глюкозо-инсулина.
Этот пример показывает, как создать простую модель программно.
Моделируйте путь регуляции генов
Этот пример показывает, как создать простую модель регуляции генов и симулировать ее.
Создайте и симулируйте модель с пользовательской функцией
Этот пример показывает, как создать пользовательскую функцию и включить ее в симуляцию модели.
SimBiology® модель является динамической системой, описанной множеством величин и математических выражений.
Можно просмотреть систему уравнений, которую создает SimBiology, когда вы создаете модель с помощью реакций, правил, событий, вариантов и доз.
A species object представляет вид, который представляет собой количество химического вещества или сущности, участвующего в реакциях.
Определения и оценки правил в SimBiology Моделей
Правила являются математическими выражениями, которые позволяют вам задавать или изменять величины модели, а именно емкость отсека, количество видов или значение параметров.
Определения и оценки реакций в SimBiology Моделей
Реакция является математическим выражением, которое описывает процесс преобразования, транспорта или связывания, который изменяет один или несколько видов.
Задайте скорости реакции с кинетикой действующих масс
Используйте кинетику действующих масс, чтобы задать реакции нулевого порядка, первого порядка, второго порядка и обратимые реакции.
Определите скорости реакции с помощью ферментативной кинетики
Используйте дифференциальные уравнения, кинетику действующих масс или кинетику Михаэлис-Ментен для определения ферментативных реакций.
В SimBiology событие является дискретным переходом в значении величины или выражения в модели.
Используйте дозы для моделирования различных схем дозирования.
Создание фармакокинетических моделей
SimBiology позволяет вам создать одно-, двух- или многокамерные фармакокинетические модели для симуляции модели и оценки параметра.
SimBiology позволяет вам найти виды, параметры, отсеки и наблюдаемые, которые не используются в модели, и узнать, как они используются.
Оценка имен компонентов модели в выражениях
SimBiology следует некоторым правилам приоритета при оценке имен в выражениях.