sbioensemblestats

Получите статистику из данных ensemble run

Синтаксис

[t,m] = sbioensemblestats(simDataObj) [t,m,v] = sbioensemblestats(simDataObj) [t,m,v,n] = sbioensemblestats(simDataObj) [t,m,v,n] = sbioensemblestats(simDataObj,names) [t,m,v,n] = sbioensemblestats(simDataObj,names,interpolation)

Аргументы

`t`	Вектор-столбец временных точек
`m`	Матрица средних значений из данных ансамбля. Количество строк в `m` - длина временного вектора `t` и количество столбцов равно количеству видов.
`simDataObj`	Массив ячеек объектов SimData, где каждый объект SimData содержит данные для отдельного запуска симуляции. Все элементы `simDataObj` должны содержать данные для тех же состояний в той же модели. Когда временные векторы элементов `simDataObj` не идентичны, `simDataObj` сначала повторно дискретизируется на общий временной вектор (см `interpolation` ниже).
`v`	Матрица отклонений, полученных из данных ансамбля. `v` имеет те же размерности, что и `m`.
`n`	Массив ячеек из символьных векторов для имен величин, среднее значение и отклонение которых возвращаются в `m` и `v`, соответственно. Количество элементов в `n` совпадает с количеством столбцов в `m` и `v`. Порядок имен в `n` соответствует порядку столбцов `m` и `v`.
`names`	Вектор символов, строка, строковый вектор, строковые массивы или массив ячеек из векторов символов. `names` могут включать квалифицированные имена, такие как '`CompartmentName.SpeciesName'` или `'ReactionName.ParameterName'` для устранения неоднозначностей. Если вы задаете пустые `{}` или пустые строковые массивы (`string.empty`) для `names`, `sbioensemblestats` возвращает статистику по всем временным курсам, содержащимся в `simDataObj`.
`interpolation`	Вектор символов или строка, обозначающая метод интерполяции для использования для повторной дискретизации данных в общем временном векторе с наименьшим временем остановки симуляции. Посмотрите `resample` для получения списка методов интерполяции. По умолчанию это `'linear'`.

Описание

[t,m] = sbioensemblestats(simDataObj) вычисляет зависящее от времени среднее значение ансамбля m данных ансамбля simDataObj. Если временные векторы данных ансамбля не идентичны, по умолчанию функция использует 'linear' метод интерполяции для повторной выборки данных в общий временной вектор. Посмотрите resample для получения списка методов интерполяции.

[t,m,v] = sbioensemblestats(simDataObj) также возвращает отклонение v для данных прогона ансамбля simDataObj.

[t,m,v,n] = sbioensemblestats(simDataObj) также возвращает имена величин n соответствующий среднему m и дисперсионные v столбцы. Каждый столбец m или v описывает среднее значение ансамбля или отклонение величины (или состояния) как функцию времени.

[t,m,v,n] = sbioensemblestats(simDataObj,names) вычисляет статистику только для величин, заданных names.

[t,m,v,n] = sbioensemblestats(simDataObj,names,interpolation) использует метод интерполяции interpolation чтобы повторно отобразить данные моделирования, имеющую последовательный временной вектор. Если временные векторы данных ансамбля не идентичны и если вы не задаете никакого метода интерполяции, функция использует 'linear' метод интерполяции по умолчанию.

Примеры

Файл проекта, radiodecay.sbproj, содержит модель, хранящуюся в переменной с именем m1. Загрузка m1 в MATLAB^® рабочей области.

Загрузка SimBiology^® модели m1 из файла проекта SimBiology.
```
sbioloadproject('radiodecay.sbproj','m1');
```
Измените решатель активной конфигурации модели, чтобы он был ssa. Также настройте LogDecimation свойство на SolverOptions свойство конфигурации модели.
```
cs = getconfigset(m1, 'active');
set(cs, 'SolverType', 'ssa');
so = get(cs, 'SolverOptions');
set(so, 'LogDecimation', 10);
```
Выполните ансамбль из 20 запусков без интерполяции.
```
simDataObj = sbioensemblerun(m1, 20);
```
Получите статистику ансамбля для всех видов с помощью метода интерполяции по умолчанию.
```
[T,M,V] = sbioensemblestats(simDataObj);
```
Получите статистику ансамбля для определенного вида с помощью схемы интерполяции по умолчанию.
```
[T2,M2,V2] = sbioensemblestats(simDataObj, {'z'});
```

См. также

sbioensembleplot | sbioensemblerun | sbiomodel

Введенный в R2006a

Документация