SensitivityAnalysisOptions

Задайте опции анализа чувствительности

Описание

The SensitivityAnalysisOptions свойство является объектом, который содержит опции анализа чувствительности в конфигурации модели объекте. Анализ чувствительности поддерживается только для детерминированных (ОДУ) симуляций.

Примечание

The SensitivityAnalysisOptions свойство управляет настройками, связанными с анализом чувствительности. Чтобы включить или отключить анализ чувствительности, используйте SensitivityAnalysis свойство.

Свойства SensitivityAnalysisOptions суммируются в Сводные данные свойств.

Когда анализ чувствительности включен, следующая команда

[t,x,names] = sbiosimulate(modelObj)

возвращает [t,x,names], где

  • t является n-by-1 вектор, где n количество шагов, предпринятых решателем оды и t определяет временные шаги решателя.

  • x является n-by-m матрица, где n количество шагов, предпринятых решателем оды и m является:

    Number of species and parameters specified in StatesToLog + 
    (Number of sensitivity outputs * Number of sensitivity input factors)
    SimBiology® состояние включает виды и неконстантные параметры.

  • names - список зарегистрированных состояний и список чувствительности видов, указанных в StatesToLog в отношении факторов входа.

Пример выхода см. в Примерах.

Можно добавить несколько объектов конфигурации модели с различными SensitivityAnalysisOptions к объекту модели с addconfigset способ. Только один объект конфигурации модели в объекте модели может иметь Active значение свойства установлено в true в любой момент времени.

Сводные данные свойств

InputsЗадайте вид и коэффициент входа параметра для анализа чувствительности
NormalizationЗадайте тип нормализации для анализа чувствительности
OutputsЗадайте виды и выходы для анализа чувствительности

Особенности

Применяется кОбъект: конфигурация модели
Тип данныхОбъект
Значения данныхSensitivityAnalysisOptions свойства, как представлено в сводных данных свойств.
ДоступТолько для чтения

Примеры

В этом примере показано, как задать SensitivityAnalysisOptions.

  1. Импортируйте модель радиораспада из демонстраций SimBiology.

    modelObj  = sbmlimport('radiodecay');
  2. Извлеките настройки строения и опции анализа чувствительности из modelObj.

    configsetObj = getconfigset(modelObj);
    sensitivityObj = get(configsetObj, 'SensitivityAnalysisOptions');
  3. Добавьте вид и параметр к Inputs свойство. Используйте sbioselect функция для извлечения видов и объектов параметров из модели.

    speciesObj = sbioselect(modelObj,'Type', 'species', 'Name', 'z');
    parameterObj = sbioselect(modelObj, 'Type', 'parameter', 'Name', 'c');
    set(sensitivityObj, 'Inputs', [speciesObj parameterObj]);
  4. Добавьте вид к Outputs свойство и отображение.

    set(sensitivityObj, 'Outputs', speciesObj);
    get(sensitivityObj, 'Outputs')
    SimBiology Species Array
    
       Index:    Compartment:    Name:    InitialAmount:    InitialAmountUnits:
       1         unnamed         z        0                 molecule
  5. Включите SensitivityAnalysis.

    set(configsetObj.SolverOptions, 'SensitivityAnalysis', true);
    get(configsetObj.SolverOptions, 'SensitivityAnalysis')
    
    ans =
    
      1
  6. Моделируйте и возвращайте результаты к трем выходным переменным. Для получения дополнительной информации см. раздел «Описание».

    [t,x,names] = sbiosimulate(modelObj);
  7. Отобразите names.

    names
    names = 
    
        'x'
        'z'
        'd[z]/d[z]_0'
        'd[z]/d[Reaction1.c]'
    

    Отобразите значения состояния x.

    x

    Отображение выполняется в соответствии с порядком столбцов, показанным на names для значений в x. Строки соответствуют t.