Класс: Модель
Симулируйте экспортированную модель SimBiology
[t,x,names]
= simulate(model)
[t,x,names]
= simulate(model,initialValues)
[t,x,names]
= simulate(model,initialValues,doses)
simDataObj = simulate(___)
[ моделирует модель, используя начальные значения по умолчанию, заданные как t,x,names]
= simulate(model)model.InitialValues (которые всегда равны InitialValue свойство на соответствующей ValueInfo объект). simulate возвращает:
t, временные выборки.
x, данные моделирования, которые содержат изменение количества состояний с течением времени.
names, метки столбцов данных моделирования x.
Можно задать дополнительную симуляцию опции с помощью свойства SimBiology.export.Model.SimulationOptions.
[ моделирует модель, используя значения, заданные в t,x,names]
= simulate(model,initialValues)initialValues как начальные значения симуляции.
[ моделирует модель, используя заданные начальные значения и дозы.t,x,names]
= simulate(model,initialValues,doses)
simDataObj = simulate(___) возвращает данные моделирования в SimData object simDataObj с использованием любого из входных параметров в предыдущих синтаксисах. The simDataObj содержит данные о времени и состоянии, а также метаданные, такие как типы и имена для сообщаемых состояний. Вы можете получить доступ к хранилищам времени, данных и имен в simDataObj использование свойств simDataObj.Time, simDataObj.Data, и simDataObj.DataNames, соответственно.
|
|
|
Вектор значений для По умолчанию: Значения, заданные в |
|
Вектор объектов дозы, определяющий дозы, используемые для симуляции. Объекты входной дозы должны быть подмножеством доз в экспортированной модели, как возвращено По умолчанию: Все объекты дозы в экспортированной модели. |
|
n -by-1 вектор временных выборок из симуляции, где n - количество временных выборок. |
|
n -by - m матрица данных моделирования, где n - количество временных выборок, а m - количество состояний, записанных во время симуляции. Каждый столбец |
|
m массив ячеек -by-1 из векторов символов с именами, помечающими строки и столбцы |
|
|
Загрузите образец объекта модели SimBiology и выберите вид y1 и y2 для симуляции.
modelObj = sbmlimport('lotka'); modelObj.getconfigset.RuntimeOptions.StatesToLog = ... sbioselect(modelObj,'Name',{'y1','y2'});
Экспортируйте объект модели.
em = export(modelObj);
Моделируйте экспортированную модель.
[t,y] = simulate(em); figure() plot(t,y)
Измените начальные условия и повторите моделирование.
xIndex = em.getIndex('x');
em.InitialValues(xIndex) = em.InitialValues(xIndex)*1.1;
[t,y] = simulate(em);
figure()
plot(t,y)