Этот пример показывает, как создать и применить вариант к модели G-белка штамма дикого типа. Вариант представляет собой значение параметров для модели G-белка мутантного штамма. Таким образом, когда вы моделируете модель, не применяя вариант, вы видите результаты для штамма дикого типа, и когда вы моделируете модель с вариантом, вы видите результаты для штамма мутанта. Этот пример использует модель, описанную в модели дрожжевого гетеротримерного цикла G-белка.
Значение параметра kGd является 0.11 для штамма дикого типа и 0.004 для мутантного штамма. Чтобы представлять мутантный штамм, вы храните альтернативное значение 0.004 для kGd параметр в объекте варианта и применить этот вариант при симуляции модели.
Для получения информации о вариантах смотрите Варианты в Модели.
Загрузите gprotein.sbproj проект, который включает переменную m1, SimBiology® объект модели.
sbioloadproject gproteinМожно создать вариант исходной модели, задав другое значение параметров для kGd параметр модели. Сначала добавьте вариант к m1 объект модели.
v1 = addvariant(m1,'mutant_strain');Далее добавьте параметр kGd со значением 0.004 к объекту варианта v1.
addcontent(v1,{'parameter','kGd','Value',0.004});Симулируйте модель дикого типа.
[t,x,names] = sbiosimulate(m1);
Симулируйте модель мутантного штамма путем применения варианта.
[tV,xV,names] = sbiosimulate(m1,v1);
Постройте и сравните моделируемые результаты.
subplot(1,2,1) plot(t,x); legend(names); xlabel('Time'); ylabel('Amount'); title('Wild Type'); subplot(1,2,2) plot(tV,xV); legend(names); xlabel('Time'); ylabel('Amount'); title('Mutant Strain');
