ClassificationPartitionedECOC
Перекрестный мультикласс модель ECOC для машин опорных векторов (SVM) и других классификаторов
Описание
ClassificationPartitionedECOC - набор моделей выходных кодов с исправлением ошибок (ECOC), обученных на перекрестных проверенных складках. Оцените качество перекрестно проверенной классификации с помощью одной или нескольких функций «kfold»: kfoldPredict, kfoldLoss, kfoldMargin, kfoldEdge, и kfoldfun.
Каждый метод «kfold» использует модели, обученные на обучающих-складных (in-fold) наблюдениях, чтобы предсказать ответ для валидационных-складных (out-of-fold) наблюдений. Например, предположим, что вы перекрестно проверяете с помощью пяти складок. В этом случае программное обеспечение случайным образом присваивает каждое наблюдение пяти группам равного размера (примерно). training fold содержит четыре группы (примерно 4/5 данных), а validation fold - другую группу (примерно 1/5 данных). В этом случае перекрестная валидация выполняется следующим образом:
Программное обеспечение обучает первую модель (хранится в
CVMdl.Trained{1}) при помощи наблюдений в последних четырех группах и резервирует наблюдения в первой группе для валидации.Программное обеспечение обучает вторую модель (хранится в
CVMdl.Trained{2}) при помощи наблюдений в первой группе и последних трех группах. Программа резервирует наблюдения во второй группе для валидации.Программа работает подобным образом для третьей, четвертой и пятой моделей.
Если вы проверяете при помощи kfoldPredictпрограмма вычисляет предсказания для наблюдений в групповых i с помощью i-й модели. Короче говоря, программное обеспечение оценивает ответ для каждого наблюдения с помощью модели, обученной без этого наблюдения.
Создание
Можно создать ClassificationPartitionedECOC моделировать двумя способами:
Свойства
Функции объекта
kfoldEdge | Классификационные ребра для перекрестно проверенной модели ECOC |
kfoldLoss | Классификационные потери для перекрестно проверенной модели ECOC |
kfoldMargin | Классификационные поля для перекрестно проверенной модели ECOC |
kfoldPredict | Классификация наблюдений в перекрестно проверенной модели ECOC |
kfoldfun | Перекрестная валидация функции с использованием перекрестной проверенной модели ECOC |
Примеры
Перекрестная проверка классификатора ECOC
Перекрестная проверка классификатора ECOC с двоичными учениками SVM и оценка обобщенной ошибки классификации.
Загрузите набор данных радужки Фишера. Задайте данные предиктора X и данные отклика Y.
load fisheriris X = meas; Y = species; rng(1); % For reproducibility
Создайте шаблон SVM и стандартизируйте предикторы.
t = templateSVM('Standardize',true)t =
Fit template for classification SVM.
Alpha: [0x1 double]
BoxConstraint: []
CacheSize: []
CachingMethod: ''
ClipAlphas: []
DeltaGradientTolerance: []
Epsilon: []
GapTolerance: []
KKTTolerance: []
IterationLimit: []
KernelFunction: ''
KernelScale: []
KernelOffset: []
KernelPolynomialOrder: []
NumPrint: []
Nu: []
OutlierFraction: []
RemoveDuplicates: []
ShrinkagePeriod: []
Solver: ''
StandardizeData: 1
SaveSupportVectors: []
VerbosityLevel: []
Version: 2
Method: 'SVM'
Type: 'classification'
t является шаблоном SVM. Большинство свойств объекта шаблона пусты. При обучении классификатора ECOC программное обеспечение устанавливает применимые свойства на их значения по умолчанию.
Обучите классификатор ECOC и укажите порядок классов.
Mdl = fitcecoc(X,Y,'Learners',t,... 'ClassNames',{'setosa','versicolor','virginica'});
Mdl является ClassificationECOC классификатор. Вы можете получить доступ к его свойствам с помощью записи через точку.
Перекрестная валидация Mdl использование 10-кратной перекрестной проверки.
CVMdl = crossval(Mdl);
CVMdl является ClassificationPartitionedECOC перекрестная проверка классификатора ECOC.
Оцените обобщенную ошибку классификации.
genError = kfoldLoss(CVMdl)
genError = 0.0400
Обобщенная ошибка классификации составляет 4%, что указывает на то, что классификатор ECOC обобщается довольно хорошо.
Ускорение обучения классификаторов ECOC с использованием раскладывания и параллельных вычислений
Обучите классификатор ECOC один от всех с помощью GentleBoost ансамбль деревьев решений с суррогатными сплитами. Чтобы ускорить обучение, числовые предикторы интервал и используйте параллельные вычисления. Раскладывание действительно только при fitcecoc использует ученика дерева. После обучения оцените ошибку классификации, используя 10-кратную перекрестную валидацию. Обратите внимание, что для параллельных вычислений требуется Parallel Computing Toolbox™.
Загрузка выборочных данных
Загрузите и осмотрите arrhythmia набор данных.
load arrhythmia
[n,p] = size(X)n = 452
p = 279
isLabels = unique(Y); nLabels = numel(isLabels)
nLabels = 13
tabulate(categorical(Y))
Value Count Percent
1 245 54.20%
2 44 9.73%
3 15 3.32%
4 15 3.32%
5 13 2.88%
6 25 5.53%
7 3 0.66%
8 2 0.44%
9 9 1.99%
10 50 11.06%
14 4 0.88%
15 5 1.11%
16 22 4.87%
Набор данных содержит 279 предикторы и размер выборки 452 относительно небольшая. Из 16 различных меток только 13 представлены в ответе (Y). Каждая метка описывает различные степени аритмии, и 54,20% наблюдений находятся в классе 1.
Обучите классификатор один от всех ECOC
Создайте шаблон ансамбля. Необходимо задать как минимум три аргумента: метод, количество учащихся и тип обучающегося. В данном примере задайте 'GentleBoost' для метода, 100 для количества учащихся и шаблона дерева решений, который использует суррогатные разделения, потому что отсутствуют наблюдения.
tTree = templateTree('surrogate','on'); tEnsemble = templateEnsemble('GentleBoost',100,tTree);
tEnsemble является объектом шаблона. Большинство его свойств пусты, но программа заполняет их значениями по умолчанию во время обучения.
Обучите классификатор ECOC один от всех, используя ансамбли деревьев решений в качестве двоичных учащихся. Чтобы ускорить обучение, используйте раскладывание и параллельные вычисления.
Раскладывание (
'NumBins',50) - Когда у вас есть большой набор обучающих данных, вы можете ускорить обучение (потенциальное снижение точности), используя'NumBins'аргумент пары "имя-значение". Этот аргумент действителен только приfitcecocиспользует ученика дерева. Если вы задаете'NumBins'Значение программное обеспечение помещает каждый числовой предиктор в заданное количество уравнительных интервалов, а затем выращивает деревья индексов интервала вместо исходных данных. Можно попробовать'NumBins',50сначала, а затем смените'NumBins'значение в зависимости от точности и скорости обучения.Параллельные вычисления (
'Options',statset('UseParallel',true)) - С лицензией Parallel Computing Toolbox можно ускорить расчеты с помощью параллельных вычислений, которые отправляют каждого двоичного ученика работнику пула. Количество работников зависит от вашего системного строения. Когда вы используете деревья принятия решений для двоичных учащихся,fitcecocпараллелизирует обучение с использованием Intel ® Threading Building Blocks (TBB) для двухъядерных систем и выше. Поэтому установка'UseParallel'опция не полезна на одном компьютере. Используйте эту опцию в кластере.
Кроме того, задайте, что предыдущие вероятности 1/K, где K = 13 - количество различных классов.
options = statset('UseParallel',true); Mdl = fitcecoc(X,Y,'Coding','onevsall','Learners',tEnsemble,... 'Prior','uniform','NumBins',50,'Options',options);
Starting parallel pool (parpool) using the 'local' profile ... Connected to the parallel pool (number of workers: 6).
Mdl является ClassificationECOC модель.
Перекрестная валидация
Перекрестная проверка классификатора ECOC с помощью 10-кратной перекрестной проверки.
CVMdl = crossval(Mdl,'Options',options);Warning: One or more folds do not contain points from all the groups.
CVMdl является ClassificationPartitionedECOC модель. Предупреждение указывает, что некоторые классы не представлены, в то время как программное обеспечение обучает по крайней мере одну складку. Поэтому эти складки не могут предсказать метки для отсутствующих классов. Результаты складки можно просмотреть с помощью индексации камер и записи через точку. Для примера получите доступ к результатам первой складки путем ввода CVMdl.Trained{1}.
Используйте перекрестно проверенный классификатор ECOC для предсказания меток гибки валидации. Можно вычислить матрицу неточностей при помощи confusionchart. Переместите и измените размер графика путем изменения свойства внутреннего положения, чтобы убедиться, что проценты появляются в сводных данных строк.
oofLabel = kfoldPredict(CVMdl,'Options',options); ConfMat = confusionchart(Y,oofLabel,'RowSummary','total-normalized'); ConfMat.InnerPosition = [0.10 0.12 0.85 0.85];
Воспроизведение связанных данных
Воспроизведите привязанные данные предиктора при помощи BinEdges свойство обученной модели и discretize функция.
X = Mdl.X; % Predictor data Xbinned = zeros(size(X)); edges = Mdl.BinEdges; % Find indices of binned predictors. idxNumeric = find(~cellfun(@isempty,edges)); if iscolumn(idxNumeric) idxNumeric = idxNumeric'; end for j = idxNumeric x = X(:,j); % Convert x to array if x is a table. if istable(x) x = table2array(x); end % Group x into bins by using the discretize function. xbinned = discretize(x,[-inf; edges{j}; inf]); Xbinned(:,j) = xbinned; end
Xbinned содержит индексы интервала в диапазоне от 1 до количества интервалов для числовых предикторов. Xbinned значения 0 для категориальных предикторов. Если X содержит NaNs, затем соответствующее Xbinned значения NaNс.
См. также
ClassificationECOC | CompactClassificationECOC | crossval | cvpartition | fitcecoc